40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48915 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48915  predicted protein  100 
 
 
516 aa  1061    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  32.58 
 
 
1346 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1877  Endonuclease I  30.71 
 
 
388 aa  98.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  34.09 
 
 
275 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  33.64 
 
 
275 aa  94  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  30.92 
 
 
1503 aa  94  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  34.15 
 
 
275 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  34.15 
 
 
275 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6326  Endonuclease I  32.82 
 
 
442 aa  91.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  34.31 
 
 
275 aa  91.3  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  30.77 
 
 
285 aa  89  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  35.38 
 
 
542 aa  87.8  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  32 
 
 
256 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1682  Endonuclease I  34.55 
 
 
267 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  32.16 
 
 
614 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  29.3 
 
 
1310 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  34.48 
 
 
538 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  34.5 
 
 
553 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  34.04 
 
 
539 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  31.54 
 
 
558 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  33.74 
 
 
617 aa  83.6  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  31.15 
 
 
558 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  32.24 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  32.77 
 
 
539 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  31.36 
 
 
657 aa  73.9  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.95 
 
 
2346 aa  73.6  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  28.93 
 
 
341 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  27.41 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf874  membrane nuclease  29.26 
 
 
314 aa  70.1  0.0000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  45.78 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  29.53 
 
 
2796 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3628  Endonuclease I  37.76 
 
 
596 aa  60.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0543  endonuclease I  25.42 
 
 
466 aa  58.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1790  hypothetical protein  31.94 
 
 
290 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0838562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  27.46 
 
 
219 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  29.71 
 
 
232 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  35.63 
 
 
311 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2661  Endonuclease I  35.71 
 
 
308 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2748  endonuclease I  27.81 
 
 
211 aa  43.5  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  28.04 
 
 
1322 aa  43.5  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>