More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1016 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  72.34 
 
 
628 aa  838    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  71.16 
 
 
629 aa  902    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
630 aa  1278    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  71.47 
 
 
629 aa  908    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  71.63 
 
 
629 aa  909    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  71.63 
 
 
629 aa  909    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  56.67 
 
 
534 aa  526  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  55.44 
 
 
489 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  49.33 
 
 
535 aa  489  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2868  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  61.8 
 
 
540 aa  481  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1522  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  51.63 
 
 
402 aa  389  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.858341  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30600  subtilisin-like serine protease  50.38 
 
 
524 aa  382  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  50.9 
 
 
403 aa  372  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176221  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  46.45 
 
 
663 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0978  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.37 
 
 
514 aa  363  5.0000000000000005e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000974435  normal  0.833181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.34 
 
 
397 aa  361  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6701  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.59 
 
 
558 aa  353  5e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1559  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  50.4 
 
 
514 aa  350  6e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.07 
 
 
597 aa  347  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21910  subtilisin-like serine protease  50.25 
 
 
586 aa  346  8.999999999999999e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.164253  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0039  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.06 
 
 
519 aa  343  5.999999999999999e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13460  subtilisin-like serine protease  49.6 
 
 
403 aa  343  7e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0044  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.61 
 
 
518 aa  341  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6580  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.38 
 
 
519 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  46.03 
 
 
596 aa  332  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.85 
 
 
391 aa  331  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0029  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.63 
 
 
411 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282311  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2361  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.95 
 
 
563 aa  326  8.000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0874111  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  46.17 
 
 
601 aa  316  7e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1838  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.94 
 
 
519 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0716705 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0312  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  45.36 
 
 
484 aa  306  8.000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4308  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  43.92 
 
 
380 aa  302  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2054  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.95 
 
 
407 aa  299  9e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6261  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.79 
 
 
427 aa  296  7e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2666  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.34 
 
 
731 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785102  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2268  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.27 
 
 
507 aa  289  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.0271027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2269  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.1 
 
 
461 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.778693  normal  0.0483153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1717  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.83 
 
 
381 aa  287  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1037  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  42.55 
 
 
393 aa  284  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3063  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.06 
 
 
833 aa  283  9e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561591  normal  0.891031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2012  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.76 
 
 
514 aa  275  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.86 
 
 
404 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.600934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27230  subtilisin-like serine protease  49.7 
 
 
801 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0273209  normal  0.322238 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10030  hypothetical serine protease (Eurofung)  39.06 
 
 
477 aa  259  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.632842  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3551  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.59 
 
 
396 aa  251  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00861424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2843  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.69 
 
 
404 aa  250  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0208392  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78783  vacuolar protease B  42.12 
 
 
544 aa  249  1e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0089514  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1252  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  42.63 
 
 
399 aa  246  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.963928  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00620  serine-type endopeptidase, putative  47.18 
 
 
518 aa  243  5e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3798  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.65 
 
 
522 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.412702  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_4493  predicted protein  38.75 
 
 
449 aa  241  2.9999999999999997e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0320757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2267  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.37 
 
 
514 aa  240  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0802197  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48491  predicted protein  43.66 
 
 
401 aa  240  5.999999999999999e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.131645  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5785  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  41.76 
 
 
401 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.41 
 
 
442 aa  236  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.883055  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3977  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  40.97 
 
 
377 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.2 
 
 
395 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  39.45 
 
 
521 aa  234  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48496  predicted protein  39.4 
 
 
460 aa  234  5e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264136  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48495  predicted protein  40.6 
 
 
472 aa  226  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05558  Alkaline proteasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00208]  44.52 
 
 
403 aa  220  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  38.92 
 
 
555 aa  219  8.999999999999998e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  39.61 
 
 
551 aa  219  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  45.1 
 
 
488 aa  218  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  40.97 
 
 
582 aa  209  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.49 
 
 
579 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.52 
 
 
494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  50.74 
 
 
553 aa  198  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48484  predicted protein  38.59 
 
 
380 aa  197  7e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00786628  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  40.8 
 
 
789 aa  184  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28842  predicted protein  45.38 
 
 
398 aa  183  9.000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.991697  normal  0.128685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.36 
 
 
520 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.09 
 
 
399 aa  179  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116357  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  40.34 
 
 
789 aa  177  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  29.56 
 
 
533 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  32.64 
 
 
560 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.07 
 
 
407 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14380  predicted protein  41.7 
 
 
247 aa  170  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.55072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.76 
 
 
495 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  40.09 
 
 
658 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.72 
 
 
583 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3301  putative serine protease  37.88 
 
 
407 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44867 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  38.74 
 
 
1315 aa  157  7e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.7 
 
 
803 aa  154  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.22 
 
 
406 aa  153  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173493  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.61 
 
 
807 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.54 
 
 
407 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264127  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.05 
 
 
595 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1710  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.82 
 
 
396 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44226  predicted protein  35.76 
 
 
328 aa  151  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0107542  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04562  extracellular protease  35.78 
 
 
454 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03059  protease  29.27 
 
 
620 aa  148  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0545  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.21 
 
 
617 aa  147  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0878069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2156  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.23 
 
 
401 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3530  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.62 
 
 
394 aa  144  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.410935  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00110  extracellular alkaline serine protease  31.6 
 
 
408 aa  143  9e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.630326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  36.01 
 
 
397 aa  140  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1185  subtilisin-like serine protease-like  38.06 
 
 
891 aa  140  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  32.68 
 
 
641 aa  140  7e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  35.51 
 
 
397 aa  140  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>