160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0556 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
494 aa  984    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  52.29 
 
 
658 aa  234  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  57.55 
 
 
628 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  53.4 
 
 
789 aa  219  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.89 
 
 
629 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48 
 
 
629 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48 
 
 
629 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.56 
 
 
629 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.47 
 
 
630 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  51.18 
 
 
553 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.54 
 
 
474 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  45.02 
 
 
789 aa  186  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1835  serine protease  34.13 
 
 
660 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5855  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.84 
 
 
261 aa  153  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0679921  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02366  serine protease similarity, trypsin family (Eurofung)  39.85 
 
 
249 aa  149  9e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.454558 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004097  secreted trypsin-like serine protease  36.63 
 
 
538 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000141932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10090  secreted trypsin-like serine protease  38.82 
 
 
262 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.811514 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2723  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.79 
 
 
552 aa  143  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547831  normal  0.0221435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5502  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.53 
 
 
275 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000292489  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01372  hypothetical protein  35.56 
 
 
268 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5869  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.71 
 
 
247 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0194  conserved repeat domain protein  32.38 
 
 
543 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1254  putative trypsin  35.74 
 
 
548 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000770222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  62.26 
 
 
775 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5868  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.21 
 
 
243 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5818  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.34 
 
 
259 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.55 
 
 
807 aa  131  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3776  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
554 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000930307  unclonable  0.00000981253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5497  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.61 
 
 
272 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000909989  normal  0.722104 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.22 
 
 
841 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  36.49 
 
 
443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3593  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.56 
 
 
650 aa  126  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  59.41 
 
 
803 aa  126  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  46.51 
 
 
807 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.2 
 
 
843 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.37 
 
 
818 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.85 
 
 
823 aa  119  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.47 
 
 
802 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.85 
 
 
807 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.7 
 
 
805 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.7 
 
 
809 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.7 
 
 
805 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  54.21 
 
 
542 aa  117  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.89 
 
 
249 aa  117  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5498  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.78 
 
 
275 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000964373  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0828  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.1 
 
 
297 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54319  predicted protein  33.73 
 
 
607 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  52.83 
 
 
778 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.28 
 
 
520 aa  114  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  52.83 
 
 
778 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  52.83 
 
 
778 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.23 
 
 
803 aa  113  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  51.89 
 
 
778 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  49.56 
 
 
774 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  51.65 
 
 
533 aa  113  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0820  putative trypsin  34.13 
 
 
403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000898339  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.53 
 
 
579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.92 
 
 
819 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  47.37 
 
 
534 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  48.25 
 
 
489 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  44.25 
 
 
558 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.83 
 
 
819 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.83 
 
 
819 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.83 
 
 
819 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  47.06 
 
 
701 aa  110  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  43.36 
 
 
558 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  54.78 
 
 
794 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  49.02 
 
 
777 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0723  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.23 
 
 
254 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5018  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.27 
 
 
270 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0219219  normal  0.251525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4627  serine protease  32.61 
 
 
702 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2220  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.3 
 
 
307 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231709  hitchhiker  0.00133623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  45.71 
 
 
677 aa  103  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  48.51 
 
 
539 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  47.06 
 
 
553 aa  99.8  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49772  predicted protein  29.55 
 
 
582 aa  98.2  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  38.67 
 
 
823 aa  97.8  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  51.96 
 
 
609 aa  97.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37254  predicted protein  31.97 
 
 
399 aa  95.5  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_7168  predicted protein  32.57 
 
 
209 aa  95.9  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000611936 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  35.57 
 
 
501 aa  94  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2703  serine protease  29.37 
 
 
298 aa  94  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2275  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.38 
 
 
288 aa  93.2  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40462  predicted protein  33.19 
 
 
508 aa  91.3  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001191  secreted trypsin-like serine protease  27.04 
 
 
379 aa  90.1  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04979  elastase  27.14 
 
 
333 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5451  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.96 
 
 
338 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  0.239065 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5708  peptidase domain protein  37.38 
 
 
492 aa  88.2  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2925  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.48 
 
 
440 aa  87.4  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109953  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2924  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.58 
 
 
432 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0719819  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.76 
 
 
260 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  hitchhiker  0.0000000383198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2926  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.8 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190852  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49602  predicted protein  31.43 
 
 
558 aa  82.8  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  43.21 
 
 
560 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  40.59 
 
 
535 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0431  putative serine protease  29.31 
 
 
330 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.410989  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  37.39 
 
 
780 aa  76.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0423  exported serine protease, trypsin elastase  28.48 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  31.52 
 
 
476 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02674  protease  40.2 
 
 
176 aa  71.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>