84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0427 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  100 
 
 		 553 aa  1132    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  55.45 
 
 		 789 aa  213  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  52.13 
 
 		 494 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  45.68 
 
 		 658 aa  207  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.72 
 
 		 629 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.49 
 
 		 629 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.49 
 
 		 629 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.76 
 
 		 629 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.74 
 
 		 630 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.47 
 
 		 628 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  47.39 
 
 		 789 aa  197  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  60 
 
 		 807 aa  147  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.5 
 
 		 807 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  56.72 
 
 		 807 aa  143  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  61.95 
 
 		 803 aa  143  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  56.25 
 
 		 819 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  57.52 
 
 		 775 aa  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.47 
 
 		 819 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.47 
 
 		 819 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  61.47 
 
 		 823 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.47 
 
 		 819 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.44 
 
 		 805 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.44 
 
 		 809 aa  137  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.44 
 
 		 805 aa  136  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  58.18 
 
 		 818 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  56.44 
 
 		 802 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  59.6 
 
 		 803 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  44.44 
 
 		 778 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  51.56 
 
 		 677 aa  127  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  43.86 
 
 		 778 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  44.44 
 
 		 778 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  44.44 
 
 		 778 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  51.82 
 
 		 542 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  43.62 
 
 		 777 aa  120  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  51.75 
 
 		 774 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  52.34 
 
 		 558 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  52.34 
 
 		 558 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  50.89 
 
 		 534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  48.21 
 
 		 489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  53.76 
 
 		 533 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  47.9 
 
 		 794 aa  109  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52 
 
 		 579 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  50.47 
 
 		 609 aa  107  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  51.52 
 
 		 539 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  48 
 
 		 553 aa  100  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  45.83 
 
 		 501 aa  100  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  46.3 
 
 		 823 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.45 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2092  hypothetical protein  29.08 
 
 		 311 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2007  hypothetical protein  28.72 
 
 		 309 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.09392  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  38.84 
 
 		 701 aa  92.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  47.19 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  42.42 
 
 		 535 aa  84  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5708  peptidase domain protein  41.49 
 
 		 492 aa  83.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1853  hypothetical protein  27.68 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  36.27 
 
 		 504 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  39.39 
 
 		 560 aa  80.1  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02448  protease  35.92 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7486  hypothetical protein  25.52 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02674  protease  38.83 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  37.04 
 
 		 780 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  31.73 
 
 		 972 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4054  hypothetical protein  25.84 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.023626 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001372  microbial collagenase secreted  25.79 
 
 		 808 aa  63.9  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00032964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1996  GDSL family lipase  27.36 
 
 		 375 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0545  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 617 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0878069 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01786  hypothetical protein  26.83 
 
 		 785 aa  62  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3306  lipolytic protein G-D-S-L family  23.78 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0384478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03059  protease  36.08 
 
 		 620 aa  60.1  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  43.68 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  26.89 
 
 		 1005 aa  57.4  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1739  GDSL family lipase  24.27 
 
 		 284 aa  57  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241667  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2652  lipolytic protein G-D-S-L family  25.43 
 
 		 287 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  26.34 
 
 		 968 aa  54.7  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  40.26 
 
 		 852 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1256  collagenase  22.58 
 
 		 539 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7152  Peptidase M9A collagenase domain protein  36.84 
 
 		 855 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.766617  normal  0.500432 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0653  Microbial collagenase  26.47 
 
 		 1041 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  34.95 
 
 		 743 aa  51.6  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0657  collagenase  25 
 
 		 1070 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3732  collagenase  25 
 
 		 1041 aa  50.4  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0630  collagenase  25.98 
 
 		 1070 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  26.01 
 
 		 2062 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  24.64 
 
 		 2632 aa  43.5  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>