104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001372 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1256  collagenase  69.8 
 
 		 539 aa  778    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01786  hypothetical protein  71.32 
 
 		 785 aa  1134    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001372  microbial collagenase secreted  100 
 
 		 808 aa  1680    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00032964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1255  collagenase  67.46 
 
 		 252 aa  347  3e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048292  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  27.34 
 
 		 1005 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  32.83 
 
 		 852 aa  276  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0639  collagenase family protein  30.58 
 
 		 1037 aa  274  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0657  collagenase  27.3 
 
 		 1070 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3732  collagenase  27.34 
 
 		 1041 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0630  collagenase  27.22 
 
 		 1070 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0653  Microbial collagenase  26.72 
 
 		 1041 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2903  Microbial collagenase  30.86 
 
 		 632 aa  263  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.439593 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  28.95 
 
 		 814 aa  263  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  30.27 
 
 		 968 aa  258  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0988  collagenase  32.55 
 
 		 661 aa  251  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2230  peptidase  32.55 
 
 		 605 aa  250  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0900  collagenase  32.55 
 
 		 645 aa  250  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6876  collagenase  32.53 
 
 		 658 aa  248  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000039324  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0694  putative collagenase  31.79 
 
 		 632 aa  241  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  31.25 
 
 		 972 aa  241  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1578  collagenase, putative  31.61 
 
 		 602 aa  241  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2419  peptidase  31.79 
 
 		 602 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337269  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1216  collagenase  31.79 
 
 		 645 aa  240  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000787421  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0773  putative collagenase  31.79 
 
 		 647 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1142  collagenase  31.79 
 
 		 647 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1736  putative collagenase  31.79 
 
 		 645 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0616  Microbial collagenase  26.78 
 
 		 787 aa  220  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00460764  normal  0.253983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7152  Peptidase M9A collagenase domain protein  26.24 
 
 		 855 aa  205  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.766617  normal  0.500432 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2966  collagenase  40.91 
 
 		 304 aa  204  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.194174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2743  collagenase  41.6 
 
 		 293 aa  202  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.981604  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1077  collagenase  39.55 
 
 		 301 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  0.459952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1458  collagenase  39.16 
 
 		 322 aa  191  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446603  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3449  collagenase  38.66 
 
 		 292 aa  187  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2237  collagenase  34.64 
 
 		 667 aa  186  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971967  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3300  collagenase  38.2 
 
 		 294 aa  185  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000170282  decreased coverage  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1517  collagenase  37.8 
 
 		 313 aa  180  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000383276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3732  collagenase  36.43 
 
 		 603 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00527905  hitchhiker  0.00286894 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0039  collagenase  38.15 
 
 		 590 aa  172  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000449009  normal  0.0513701 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0042  collagenase  37.3 
 
 		 587 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53761  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0035  collagenase  33.86 
 
 		 519 aa  150  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.38 
 
 		 629 aa  88.2  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.38 
 
 		 629 aa  88.2  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  24.54 
 
 		 1018 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  24.77 
 
 		 971 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  24.24 
 
 		 971 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.44 
 
 		 629 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.44 
 
 		 629 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  24.31 
 
 		 971 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  24.31 
 
 		 971 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  23.78 
 
 		 971 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  23.78 
 
 		 971 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  23.78 
 
 		 971 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  24.01 
 
 		 971 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  23.54 
 
 		 971 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.36 
 
 		 628 aa  72  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  26.12 
 
 		 967 aa  70.9  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2821  collagenase  22.98 
 
 		 878 aa  67.4  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.342528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  25.56 
 
 		 965 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  25.19 
 
 		 965 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  24.81 
 
 		 965 aa  64.7  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.23 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  25.79 
 
 		 553 aa  64.3  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  24.81 
 
 		 965 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  24.81 
 
 		 965 aa  63.9  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  24.81 
 
 		 965 aa  63.9  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  24.81 
 
 		 965 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  24.81 
 
 		 965 aa  63.9  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  24.81 
 
 		 965 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  25.78 
 
 		 658 aa  63.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  20.83 
 
 		 1104 aa  62.4  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  20.83 
 
 		 1104 aa  62.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3027  microbial collagenase  22.98 
 
 		 878 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  24.44 
 
 		 965 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  24.29 
 
 		 960 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.78 
 
 		 630 aa  59.3  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5655  collagenase  22.7 
 
 		 878 aa  58.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.123468 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  20.19 
 
 		 960 aa  56.2  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  20.19 
 
 		 960 aa  56.2  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.32 
 
 		 819 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.32 
 
 		 819 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.32 
 
 		 819 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 		 819 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.97 
 
 		 823 aa  51.6  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1418  hypothetical protein  22.27 
 
 		 552 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0422281  normal  0.0166788 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  31.58 
 
 		 803 aa  51.2  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  31.07 
 
 		 775 aa  50.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5708  peptidase domain protein  30 
 
 		 492 aa  50.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  33.68 
 
 		 794 aa  48.5  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  28.46 
 
 		 774 aa  48.5  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  30.1 
 
 		 778 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  31.18 
 
 		 535 aa  47.8  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  26.56 
 
 		 807 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  29.13 
 
 		 778 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  29.13 
 
 		 778 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  29.13 
 
 		 778 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.84 
 
 		 803 aa  46.2  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.4 
 
 		 805 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.27 
 
 		 809 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.4 
 
 		 805 aa  45.8  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.47 
 
 		 807 aa  45.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>