86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0657 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0653  Microbial collagenase  98.85 
 
 
1041 aa  2146    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  65.56 
 
 
1005 aa  1358    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0639  collagenase family protein  74.81 
 
 
1037 aa  1623    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0657  collagenase  100 
 
 
1070 aa  2230    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0630  collagenase  98.97 
 
 
1070 aa  2211    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3732  collagenase  99.14 
 
 
1041 aa  2152    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  36.24 
 
 
852 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  34.47 
 
 
968 aa  436  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2903  Microbial collagenase  38.23 
 
 
632 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.439593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  36.67 
 
 
972 aa  353  7e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0616  Microbial collagenase  32.24 
 
 
787 aa  348  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00460764  normal  0.253983 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  30.28 
 
 
814 aa  345  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2230  peptidase  34.35 
 
 
605 aa  330  9e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0694  putative collagenase  34.59 
 
 
632 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117227  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0900  collagenase  34.18 
 
 
645 aa  329  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0773  putative collagenase  34.59 
 
 
647 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0988  collagenase  34.47 
 
 
661 aa  329  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244986  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1142  collagenase  34.59 
 
 
647 aa  328  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1736  putative collagenase  34.59 
 
 
645 aa  328  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6876  collagenase  34.62 
 
 
658 aa  328  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000039324  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1578  collagenase, putative  34.45 
 
 
602 aa  326  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1216  collagenase  34.43 
 
 
645 aa  326  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000787421  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2419  peptidase  34.98 
 
 
602 aa  325  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7152  Peptidase M9A collagenase domain protein  29.55 
 
 
855 aa  296  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.766617  normal  0.500432 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01786  hypothetical protein  27.61 
 
 
785 aa  282  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001372  microbial collagenase secreted  26.92 
 
 
808 aa  273  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00032964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1256  collagenase  30.16 
 
 
539 aa  230  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029967  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1077  collagenase  42.65 
 
 
301 aa  224  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  0.459952 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3732  collagenase  42.64 
 
 
603 aa  222  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00527905  hitchhiker  0.00286894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0042  collagenase  44.31 
 
 
587 aa  218  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53761  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1517  collagenase  39.19 
 
 
313 aa  213  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000383276  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2966  collagenase  43.82 
 
 
304 aa  212  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.194174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3449  collagenase  41.54 
 
 
292 aa  210  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2743  collagenase  41.86 
 
 
293 aa  210  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.981604  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3300  collagenase  40.98 
 
 
294 aa  209  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000170282  decreased coverage  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0039  collagenase  39.33 
 
 
590 aa  209  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000449009  normal  0.0513701 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2237  collagenase  44.49 
 
 
667 aa  209  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0035  collagenase  42.21 
 
 
519 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1458  collagenase  40.39 
 
 
322 aa  198  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  23.31 
 
 
971 aa  95.1  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  23.31 
 
 
971 aa  95.1  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  22.89 
 
 
971 aa  89.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  22.93 
 
 
971 aa  89.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  22.93 
 
 
971 aa  88.6  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  23.03 
 
 
1018 aa  88.2  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  22.16 
 
 
971 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  22.16 
 
 
971 aa  87  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  23.08 
 
 
971 aa  87  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  23 
 
 
1104 aa  87  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  22.67 
 
 
1104 aa  84.7  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  22.56 
 
 
971 aa  84  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  22.46 
 
 
965 aa  78.2  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  22.28 
 
 
965 aa  74.7  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  22.28 
 
 
965 aa  74.7  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  22.55 
 
 
965 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  22.04 
 
 
965 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  22.24 
 
 
965 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  20.32 
 
 
965 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  22.04 
 
 
965 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  21.12 
 
 
965 aa  73.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  22.04 
 
 
965 aa  71.6  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5655  collagenase  20.4 
 
 
878 aa  63.9  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.123468 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  21.34 
 
 
967 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2821  collagenase  32.61 
 
 
878 aa  62.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.342528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  24.39 
 
 
960 aa  62.4  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  24.39 
 
 
960 aa  62.4  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3027  microbial collagenase  22.38 
 
 
878 aa  62  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  26.81 
 
 
658 aa  61.6  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  23.98 
 
 
960 aa  60.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.5 
 
 
629 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.5 
 
 
629 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.5 
 
 
629 aa  58.5  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.08 
 
 
629 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  25.98 
 
 
553 aa  50.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.39 
 
 
494 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  37.11 
 
 
533 aa  49.3  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  35.96 
 
 
807 aa  48.5  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4303  peptidase-like  23.54 
 
 
1289 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0594037  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  30.71 
 
 
534 aa  46.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.88 
 
 
628 aa  46.2  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  32.48 
 
 
558 aa  45.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1255  collagenase  21.84 
 
 
252 aa  45.4  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048292  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.82 
 
 
630 aa  45.1  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  30.63 
 
 
609 aa  44.7  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.67 
 
 
805 aa  44.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  30.77 
 
 
489 aa  44.7  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>