82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0648 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0653  Microbial collagenase  65.46 
 
 		 1041 aa  1348    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  100 
 
 		 1005 aa  2075    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0657  collagenase  65.56 
 
 		 1070 aa  1345    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0639  collagenase family protein  63.54 
 
 		 1037 aa  1359    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0630  collagenase  65.76 
 
 		 1070 aa  1353    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3732  collagenase  65.26 
 
 		 1041 aa  1343    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  44.02 
 
 		 852 aa  472  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  33.85 
 
 		 972 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  34.64 
 
 		 968 aa  451  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2903  Microbial collagenase  41 
 
 		 632 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.439593 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  31.38 
 
 		 814 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0616  Microbial collagenase  36.7 
 
 		 787 aa  361  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00460764  normal  0.253983 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2230  peptidase  34.59 
 
 		 605 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0900  collagenase  32.96 
 
 		 645 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0988  collagenase  32.96 
 
 		 661 aa  324  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244986  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1578  collagenase, putative  33.94 
 
 		 602 aa  317  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6876  collagenase  33.78 
 
 		 658 aa  316  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000039324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0773  putative collagenase  34.12 
 
 		 647 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1736  putative collagenase  34.12 
 
 		 645 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0694  putative collagenase  34.12 
 
 		 632 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117227  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2419  peptidase  34.12 
 
 		 602 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337269  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1142  collagenase  34.12 
 
 		 647 aa  313  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1216  collagenase  33.94 
 
 		 645 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000787421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7152  Peptidase M9A collagenase domain protein  31.39 
 
 		 855 aa  308  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.766617  normal  0.500432 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001372  microbial collagenase secreted  27.34 
 
 		 808 aa  283  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00032964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01786  hypothetical protein  27.95 
 
 		 785 aa  266  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1256  collagenase  29.46 
 
 		 539 aa  228  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029967  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1077  collagenase  42.7 
 
 		 301 aa  227  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  0.459952 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2966  collagenase  45.42 
 
 		 304 aa  227  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.194174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3449  collagenase  43.46 
 
 		 292 aa  226  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3300  collagenase  43.23 
 
 		 294 aa  225  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000170282  decreased coverage  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2743  collagenase  43.28 
 
 		 293 aa  219  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.981604  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0042  collagenase  39.53 
 
 		 587 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53761  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3732  collagenase  40.84 
 
 		 603 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00527905  hitchhiker  0.00286894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1458  collagenase  40.53 
 
 		 322 aa  211  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446603  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0039  collagenase  42.58 
 
 		 590 aa  210  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000449009  normal  0.0513701 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2237  collagenase  42.86 
 
 		 667 aa  209  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971967  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1517  collagenase  42.68 
 
 		 313 aa  208  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000383276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0035  collagenase  40.38 
 
 		 519 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  24.21 
 
 		 971 aa  92.8  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  24.21 
 
 		 971 aa  92.8  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  24.21 
 
 		 971 aa  92  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  23.47 
 
 		 971 aa  91.3  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  23.62 
 
 		 1018 aa  90.9  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  23.21 
 
 		 971 aa  88.2  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  23.27 
 
 		 971 aa  87.8  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  22.83 
 
 		 971 aa  86.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  22.24 
 
 		 971 aa  85.9  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  22.9 
 
 		 971 aa  85.5  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  22.25 
 
 		 965 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  22.18 
 
 		 965 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  20.79 
 
 		 965 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  22.25 
 
 		 965 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2821  collagenase  20.12 
 
 		 878 aa  82.8  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.342528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  22.25 
 
 		 965 aa  81.6  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  22.05 
 
 		 965 aa  81.6  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  22.05 
 
 		 965 aa  81.6  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  22.05 
 
 		 965 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3027  microbial collagenase  20.94 
 
 		 878 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  21.62 
 
 		 965 aa  81.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  21.41 
 
 		 965 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5655  collagenase  19.51 
 
 		 878 aa  74.7  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.123468 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  19.87 
 
 		 967 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  25.93 
 
 		 1104 aa  66.6  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  25.86 
 
 		 1104 aa  67  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  20.93 
 
 		 960 aa  65.1  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  22.01 
 
 		 960 aa  63.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  22.01 
 
 		 960 aa  63.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.16 
 
 		 629 aa  59.3  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.16 
 
 		 629 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.16 
 
 		 629 aa  59.3  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.16 
 
 		 629 aa  58.5  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  27.62 
 
 		 553 aa  57.4  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  27.54 
 
 		 658 aa  54.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.47 
 
 		 494 aa  51.6  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  34.65 
 
 		 489 aa  50.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1418  hypothetical protein  25.68 
 
 		 552 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0422281  normal  0.0166788 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  25.93 
 
 		 789 aa  48.1  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.37 
 
 		 630 aa  46.2  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  28.7 
 
 		 558 aa  46.2  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.12 
 
 		 579 aa  45.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  28.7 
 
 		 558 aa  45.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>