59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1418 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1697  peptidase M9A collagenase domain-containing protein  74.19 
 
 		 554 aa  690    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367258  hitchhiker  0.00906719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1418  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1102    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0422281  normal  0.0166788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0872  peptidase M9A collagenase domain-containing protein  38.04 
 
 		 565 aa  276  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0507103 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  39.42 
 
 		 1104 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  39.42 
 
 		 1104 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  29.19 
 
 		 967 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3027  microbial collagenase  26.96 
 
 		 878 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5655  collagenase  26.27 
 
 		 878 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.123468 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  27.43 
 
 		 971 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  27.96 
 
 		 960 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  28 
 
 		 971 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  27.43 
 
 		 971 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  27.43 
 
 		 971 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  28 
 
 		 971 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2821  collagenase  28.06 
 
 		 878 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.342528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  36.73 
 
 		 1018 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  27.57 
 
 		 965 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  27.57 
 
 		 965 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  28.11 
 
 		 965 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  27.57 
 
 		 965 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  27.57 
 
 		 965 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  28.11 
 
 		 965 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  27.57 
 
 		 965 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  27.57 
 
 		 965 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  27.57 
 
 		 965 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  36.73 
 
 		 971 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  36.73 
 
 		 971 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  36.73 
 
 		 971 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  36.73 
 
 		 971 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  28.8 
 
 		 965 aa  67  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  26.49 
 
 		 960 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  26.49 
 
 		 960 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1256  collagenase  24.65 
 
 		 539 aa  54.7  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029967  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3732  collagenase  21.82 
 
 		 603 aa  53.9  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00527905  hitchhiker  0.00286894 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0988  collagenase  27.62 
 
 		 661 aa  53.9  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2230  peptidase  27.62 
 
 		 605 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0900  collagenase  27.62 
 
 		 645 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01786  hypothetical protein  23.5 
 
 		 785 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1578  collagenase, putative  26.32 
 
 		 602 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6876  collagenase  27.07 
 
 		 658 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000039324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001372  microbial collagenase secreted  22.27 
 
 		 808 aa  52  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00032964  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1077  collagenase  24.89 
 
 		 301 aa  50.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  0.459952 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0039  collagenase  23.12 
 
 		 590 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000449009  normal  0.0513701 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  25.68 
 
 		 1005 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1517  collagenase  23.55 
 
 		 313 aa  49.7  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000383276  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0694  putative collagenase  25.97 
 
 		 632 aa  47.8  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117227  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0657  collagenase  23.05 
 
 		 1070 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1142  collagenase  31.82 
 
 		 647 aa  47.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0773  putative collagenase  31.82 
 
 		 647 aa  47.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1736  putative collagenase  31.82 
 
 		 645 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1216  collagenase  31.82 
 
 		 645 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000787421  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2419  peptidase  31.82 
 
 		 602 aa  47  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337269  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0042  collagenase  21.24 
 
 		 587 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53761  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0630  collagenase  23.05 
 
 		 1070 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3732  collagenase  23.55 
 
 		 1041 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  22.45 
 
 		 814 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2237  collagenase  21.51 
 
 		 667 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2903  Microbial collagenase  22.52 
 
 		 632 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.439593 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0653  Microbial collagenase  23.19 
 
 		 1041 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>