72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6876 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2419  peptidase  92.52 
 
 
602 aa  1164    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337269  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1142  collagenase  90.23 
 
 
647 aa  1216    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0900  collagenase  78.48 
 
 
645 aa  1050    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1216  collagenase  90.23 
 
 
645 aa  1218    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000787421  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0988  collagenase  78.16 
 
 
661 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0773  putative collagenase  90.08 
 
 
647 aa  1214    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1736  putative collagenase  90.08 
 
 
645 aa  1214    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1578  collagenase, putative  90.53 
 
 
602 aa  1142    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6876  collagenase  100 
 
 
658 aa  1365    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000039324  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2230  peptidase  80.23 
 
 
605 aa  1030    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0694  putative collagenase  90.66 
 
 
632 aa  1195    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  35.16 
 
 
852 aa  342  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0639  collagenase family protein  33.99 
 
 
1037 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0630  collagenase  34.83 
 
 
1070 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0657  collagenase  35.37 
 
 
1070 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2903  Microbial collagenase  32.46 
 
 
632 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.439593 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0653  Microbial collagenase  34.65 
 
 
1041 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3732  collagenase  34.65 
 
 
1041 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  33.78 
 
 
1005 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  33.59 
 
 
814 aa  302  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  32.17 
 
 
968 aa  291  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  33.39 
 
 
972 aa  283  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0616  Microbial collagenase  31.81 
 
 
787 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00460764  normal  0.253983 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1173  hypothetical protein  60.54 
 
 
266 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198365  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0069  peptidase  69.14 
 
 
189 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.342109  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001372  microbial collagenase secreted  32.53 
 
 
808 aa  248  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00032964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7152  Peptidase M9A collagenase domain protein  30.74 
 
 
855 aa  234  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.766617  normal  0.500432 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01786  hypothetical protein  33.73 
 
 
785 aa  227  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1517  collagenase  43.37 
 
 
313 aa  223  8e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000383276  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1256  collagenase  38.1 
 
 
539 aa  219  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029967  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2237  collagenase  39.06 
 
 
667 aa  204  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971967  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0039  collagenase  37.8 
 
 
590 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000449009  normal  0.0513701 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3732  collagenase  37.4 
 
 
603 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00527905  hitchhiker  0.00286894 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1077  collagenase  37.08 
 
 
301 aa  194  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  0.459952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0042  collagenase  37.3 
 
 
587 aa  194  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53761  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2966  collagenase  38.15 
 
 
304 aa  192  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.194174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2743  collagenase  35.11 
 
 
293 aa  187  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.981604  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0035  collagenase  35.34 
 
 
519 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3300  collagenase  34.96 
 
 
294 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000170282  decreased coverage  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3449  collagenase  33.71 
 
 
292 aa  177  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1458  collagenase  35.25 
 
 
322 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  26.74 
 
 
1104 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  26.74 
 
 
1104 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  25.35 
 
 
971 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  25.35 
 
 
971 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  25.35 
 
 
971 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  25.35 
 
 
971 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  27.05 
 
 
971 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  25.35 
 
 
1018 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  27.05 
 
 
971 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  25.53 
 
 
971 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  25.18 
 
 
971 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  24.22 
 
 
967 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  24.65 
 
 
971 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  27.14 
 
 
965 aa  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  25.6 
 
 
960 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  25.94 
 
 
965 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  26.51 
 
 
965 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  26.51 
 
 
965 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  25.94 
 
 
965 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  25.94 
 
 
965 aa  65.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2821  collagenase  26.57 
 
 
878 aa  65.1  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.342528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  25.94 
 
 
965 aa  65.1  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  25.94 
 
 
965 aa  65.1  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3027  microbial collagenase  26.09 
 
 
878 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  25.47 
 
 
965 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  25.47 
 
 
965 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  25.71 
 
 
960 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  25.71 
 
 
960 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5655  collagenase  24.51 
 
 
878 aa  60.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.123468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1697  peptidase M9A collagenase domain-containing protein  25.87 
 
 
554 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367258  hitchhiker  0.00906719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1418  hypothetical protein  27.07 
 
 
552 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0422281  normal  0.0166788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>