58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1697 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1418  hypothetical protein  74.19 
 
 
552 aa  798    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0422281  normal  0.0166788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1697  peptidase M9A collagenase domain-containing protein  100 
 
 
554 aa  1108    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367258  hitchhiker  0.00906719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0872  peptidase M9A collagenase domain-containing protein  40.07 
 
 
565 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0507103 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  31.91 
 
 
967 aa  87.8  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  29.94 
 
 
971 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  29.94 
 
 
971 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  41.51 
 
 
1104 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  41.51 
 
 
1104 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  29.72 
 
 
965 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  30.51 
 
 
971 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  30.51 
 
 
971 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  29.72 
 
 
965 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  29.94 
 
 
971 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  29.72 
 
 
965 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  29.58 
 
 
965 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5655  collagenase  28.92 
 
 
878 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.123468 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3027  microbial collagenase  28.21 
 
 
878 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  30.16 
 
 
960 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  30.85 
 
 
965 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  30.85 
 
 
965 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  30.85 
 
 
965 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  31.52 
 
 
965 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  31.52 
 
 
965 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2821  collagenase  28.72 
 
 
878 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.342528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  28.81 
 
 
971 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  28.81 
 
 
1018 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  28.81 
 
 
971 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  28.81 
 
 
971 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  28.81 
 
 
971 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  30.73 
 
 
965 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  29.26 
 
 
960 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  29.26 
 
 
960 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6876  collagenase  26.03 
 
 
658 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000039324  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1578  collagenase, putative  25.38 
 
 
602 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0988  collagenase  26.78 
 
 
661 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244986  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0900  collagenase  26.78 
 
 
645 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2230  peptidase  26.78 
 
 
605 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0694  putative collagenase  26.29 
 
 
632 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117227  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2419  peptidase  26.29 
 
 
602 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337269  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1736  putative collagenase  26.29 
 
 
645 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1142  collagenase  26.29 
 
 
647 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1216  collagenase  26.29 
 
 
645 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000787421  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0773  putative collagenase  26.29 
 
 
647 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3732  collagenase  23.48 
 
 
603 aa  54.7  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00527905  hitchhiker  0.00286894 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1517  collagenase  24.51 
 
 
313 aa  52.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000383276  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  30.4 
 
 
814 aa  51.2  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2903  Microbial collagenase  24.14 
 
 
632 aa  50.4  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.439593 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01786  hypothetical protein  24.21 
 
 
785 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2237  collagenase  20.18 
 
 
667 aa  48.5  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0616  Microbial collagenase  21.72 
 
 
787 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00460764  normal  0.253983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1077  collagenase  29.53 
 
 
301 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  0.459952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  24 
 
 
1005 aa  45.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  29.46 
 
 
972 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2743  collagenase  23.75 
 
 
293 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.981604  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001372  microbial collagenase secreted  21.36 
 
 
808 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00032964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  28.32 
 
 
852 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  28.57 
 
 
968 aa  43.5  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2966  collagenase  25.61 
 
 
304 aa  43.5  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.194174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>