71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2237 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2237  collagenase  100 
 
 		 667 aa  1391    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971967  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0039  collagenase  39.93 
 
 		 590 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000449009  normal  0.0513701 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3732  collagenase  37.81 
 
 		 603 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00527905  hitchhiker  0.00286894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0042  collagenase  40.32 
 
 		 587 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53761  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0035  collagenase  39.09 
 
 		 519 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1517  collagenase  44.88 
 
 		 313 aa  271  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000383276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  41.63 
 
 		 972 aa  212  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3732  collagenase  44.72 
 
 		 1041 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0653  Microbial collagenase  44.72 
 
 		 1041 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0988  collagenase  39.92 
 
 		 661 aa  211  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2230  peptidase  39.92 
 
 		 605 aa  210  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0900  collagenase  39.92 
 
 		 645 aa  210  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  42.86 
 
 		 814 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  42.86 
 
 		 1005 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0657  collagenase  44.49 
 
 		 1070 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0630  collagenase  44.49 
 
 		 1070 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0639  collagenase family protein  43.09 
 
 		 1037 aa  208  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  40.65 
 
 		 852 aa  207  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2966  collagenase  42.22 
 
 		 304 aa  207  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.194174  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1578  collagenase, putative  40.41 
 
 		 602 aa  205  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0694  putative collagenase  40.24 
 
 		 632 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117227  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0773  putative collagenase  40.24 
 
 		 647 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1736  putative collagenase  40.24 
 
 		 645 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  41.94 
 
 		 968 aa  205  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2419  peptidase  40.24 
 
 		 602 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337269  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1216  collagenase  40.24 
 
 		 645 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000787421  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1142  collagenase  40.24 
 
 		 647 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6876  collagenase  39.06 
 
 		 658 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000039324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3449  collagenase  39.34 
 
 		 292 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1077  collagenase  38.75 
 
 		 301 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  0.459952 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2743  collagenase  37.18 
 
 		 293 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.981604  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1256  collagenase  37.83 
 
 		 539 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029967  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1458  collagenase  38.66 
 
 		 322 aa  191  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2903  Microbial collagenase  39.36 
 
 		 632 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.439593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3300  collagenase  36.4 
 
 		 294 aa  184  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000170282  decreased coverage  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001372  microbial collagenase secreted  35.5 
 
 		 808 aa  184  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00032964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01786  hypothetical protein  36.4 
 
 		 785 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7152  Peptidase M9A collagenase domain protein  34.78 
 
 		 855 aa  144  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.766617  normal  0.500432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0616  Microbial collagenase  30.68 
 
 		 787 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00460764  normal  0.253983 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  28.44 
 
 		 1104 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  28.44 
 
 		 1104 aa  73.9  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  30.88 
 
 		 971 aa  62  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  30.88 
 
 		 971 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  30.88 
 
 		 971 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  30.88 
 
 		 1018 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  30.88 
 
 		 971 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  30.88 
 
 		 971 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2821  collagenase  30.71 
 
 		 878 aa  62  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.342528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  30.88 
 
 		 971 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  30.88 
 
 		 971 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  24.26 
 
 		 965 aa  61.2  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  24.26 
 
 		 965 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  30.15 
 
 		 971 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  30.15 
 
 		 971 aa  60.8  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  24.26 
 
 		 965 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  24.26 
 
 		 965 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  24.26 
 
 		 965 aa  60.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  24.26 
 
 		 965 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  24.26 
 
 		 965 aa  60.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  24.26 
 
 		 965 aa  60.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  23.76 
 
 		 965 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  24.26 
 
 		 965 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3027  microbial collagenase  29.92 
 
 		 878 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  31.16 
 
 		 967 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  27.94 
 
 		 960 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5655  collagenase  28.12 
 
 		 878 aa  55.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.123468 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  27.94 
 
 		 960 aa  55.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  27.94 
 
 		 960 aa  55.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0047  hypothetical protein  37.14 
 
 		 88 aa  53.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.686583  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1697  peptidase M9A collagenase domain-containing protein  25.17 
 
 		 554 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367258  hitchhiker  0.00906719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1418  hypothetical protein  21.86 
 
 		 552 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0422281  normal  0.0166788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>