72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1142 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6876  collagenase  90.23 
 
 		 658 aa  1216    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000039324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1736  putative collagenase  99.53 
 
 		 645 aa  1328    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1142  collagenase  100 
 
 		 647 aa  1338    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0900  collagenase  81.49 
 
 		 645 aa  1083    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1216  collagenase  99.69 
 
 		 645 aa  1330    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000787421  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0988  collagenase  81.17 
 
 		 661 aa  1082    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0773  putative collagenase  99.54 
 
 		 647 aa  1333    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1578  collagenase, putative  93.52 
 
 		 602 aa  1173    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2419  peptidase  99.67 
 
 		 602 aa  1244    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337269  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2230  peptidase  83.55 
 
 		 605 aa  1065    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0694  putative collagenase  99.37 
 
 		 632 aa  1298    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  35.49 
 
 		 852 aa  344  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0639  collagenase family protein  34.65 
 
 		 1037 aa  330  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0657  collagenase  33.6 
 
 		 1070 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0630  collagenase  33.66 
 
 		 1070 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0653  Microbial collagenase  33.49 
 
 		 1041 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2903  Microbial collagenase  32.83 
 
 		 632 aa  319  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.439593 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3732  collagenase  34.05 
 
 		 1041 aa  319  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  34.12 
 
 		 1005 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  33.78 
 
 		 814 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  32.3 
 
 		 968 aa  290  6e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  31.66 
 
 		 972 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1173  hypothetical protein  61.43 
 
 		 266 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0616  Microbial collagenase  33.45 
 
 		 787 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00460764  normal  0.253983 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0069  peptidase  71.43 
 
 		 189 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.342109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7152  Peptidase M9A collagenase domain protein  32.71 
 
 		 855 aa  243  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.766617  normal  0.500432 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001372  microbial collagenase secreted  31.79 
 
 		 808 aa  239  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00032964  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1517  collagenase  42.91 
 
 		 313 aa  223  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000383276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01786  hypothetical protein  33.98 
 
 		 785 aa  223  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1256  collagenase  37.41 
 
 		 539 aa  209  9e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029967  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2237  collagenase  40.24 
 
 		 667 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971967  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1077  collagenase  39.39 
 
 		 301 aa  201  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  0.459952 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0039  collagenase  38.21 
 
 		 590 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000449009  normal  0.0513701 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3732  collagenase  38 
 
 		 603 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00527905  hitchhiker  0.00286894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0042  collagenase  36.25 
 
 		 587 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53761  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2966  collagenase  37.27 
 
 		 304 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.194174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2743  collagenase  35.5 
 
 		 293 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.981604  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3300  collagenase  36.09 
 
 		 294 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000170282  decreased coverage  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3449  collagenase  35.61 
 
 		 292 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0035  collagenase  35.34 
 
 		 519 aa  180  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1458  collagenase  34.35 
 
 		 322 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446603  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  25.26 
 
 		 1104 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  25.26 
 
 		 1104 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  32 
 
 		 971 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  32 
 
 		 971 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  32 
 
 		 971 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  27.54 
 
 		 971 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  27.54 
 
 		 971 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  32 
 
 		 971 aa  66.6  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  32 
 
 		 1018 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  27.54 
 
 		 971 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  27.05 
 
 		 971 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  31.2 
 
 		 971 aa  65.1  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  24.88 
 
 		 960 aa  64.3  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  24.88 
 
 		 960 aa  64.3  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  25.96 
 
 		 967 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2821  collagenase  31.2 
 
 		 878 aa  63.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.342528  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  24.41 
 
 		 960 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  27.62 
 
 		 965 aa  62.4  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3027  microbial collagenase  30.4 
 
 		 878 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  31.25 
 
 		 965 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  31.25 
 
 		 965 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  30.4 
 
 		 965 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  30.4 
 
 		 965 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  30.4 
 
 		 965 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  30.4 
 
 		 965 aa  60.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  30.4 
 
 		 965 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  30.4 
 
 		 965 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  30.4 
 
 		 965 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5655  collagenase  25.12 
 
 		 878 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.123468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1697  peptidase M9A collagenase domain-containing protein  31.3 
 
 		 554 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367258  hitchhiker  0.00906719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1418  hypothetical protein  31.82 
 
 		 552 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0422281  normal  0.0166788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>