239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003663 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  100 
 
 		 814 aa  1688    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  34.97 
 
 		 852 aa  429  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  31.38 
 
 		 1005 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  33.47 
 
 		 968 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  30.69 
 
 		 972 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0630  collagenase  30.9 
 
 		 1070 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0653  Microbial collagenase  30.4 
 
 		 1041 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0657  collagenase  30.28 
 
 		 1070 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3732  collagenase  30.28 
 
 		 1041 aa  337  7e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0639  collagenase family protein  31.29 
 
 		 1037 aa  335  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2903  Microbial collagenase  33.89 
 
 		 632 aa  323  7e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.439593 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0988  collagenase  34.54 
 
 		 661 aa  318  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2230  peptidase  34.54 
 
 		 605 aa  318  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0900  collagenase  34.54 
 
 		 645 aa  318  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1736  putative collagenase  33.78 
 
 		 645 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0773  putative collagenase  33.78 
 
 		 647 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1142  collagenase  33.78 
 
 		 647 aa  308  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0694  putative collagenase  33.78 
 
 		 632 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117227  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2419  peptidase  33.59 
 
 		 602 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337269  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1216  collagenase  33.59 
 
 		 645 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000787421  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1578  collagenase, putative  33.21 
 
 		 602 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6876  collagenase  33.59 
 
 		 658 aa  302  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000039324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7152  Peptidase M9A collagenase domain protein  28.99 
 
 		 855 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.766617  normal  0.500432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0616  Microbial collagenase  31.6 
 
 		 787 aa  277  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00460764  normal  0.253983 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01786  hypothetical protein  31.15 
 
 		 785 aa  261  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001372  microbial collagenase secreted  28.82 
 
 		 808 aa  260  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00032964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2743  collagenase  44.7 
 
 		 293 aa  231  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.981604  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1077  collagenase  44.12 
 
 		 301 aa  228  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  0.459952 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2966  collagenase  43.98 
 
 		 304 aa  221  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.194174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0042  collagenase  38.11 
 
 		 587 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53761  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1458  collagenase  40.75 
 
 		 322 aa  218  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446603  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3449  collagenase  41.42 
 
 		 292 aa  218  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0039  collagenase  37.43 
 
 		 590 aa  217  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000449009  normal  0.0513701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1517  collagenase  41.41 
 
 		 313 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000383276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3300  collagenase  41.79 
 
 		 294 aa  213  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000170282  decreased coverage  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1256  collagenase  38.89 
 
 		 539 aa  211  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029967  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3732  collagenase  36.19 
 
 		 603 aa  211  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00527905  hitchhiker  0.00286894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2237  collagenase  42.86 
 
 		 667 aa  209  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0035  collagenase  36.97 
 
 		 519 aa  197  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  22.4 
 
 		 971 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  21.89 
 
 		 971 aa  92  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  21.77 
 
 		 971 aa  88.2  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  21.26 
 
 		 971 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  35.8 
 
 		 965 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  21.42 
 
 		 971 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  35.8 
 
 		 965 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  35.8 
 
 		 965 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  21.61 
 
 		 971 aa  85.1  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  21.61 
 
 		 971 aa  85.1  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  22.03 
 
 		 971 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  22.03 
 
 		 971 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  37.31 
 
 		 965 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  31.31 
 
 		 967 aa  84  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  36.57 
 
 		 965 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  36.57 
 
 		 965 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  21.29 
 
 		 1018 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  37.31 
 
 		 965 aa  82.8  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  36.57 
 
 		 965 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  33.33 
 
 		 965 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  35.82 
 
 		 965 aa  80.9  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2821  collagenase  20.85 
 
 		 878 aa  80.9  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.342528  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  47.67 
 
 		 816 aa  80.1  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  34.33 
 
 		 960 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3027  microbial collagenase  20.5 
 
 		 878 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  52.17 
 
 		 792 aa  75.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  39.18 
 
 		 884 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  32.84 
 
 		 960 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  32.84 
 
 		 960 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  52.44 
 
 		 840 aa  73.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  42.53 
 
 		 623 aa  71.2  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  20.47 
 
 		 1104 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  20.3 
 
 		 1104 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  33.1 
 
 		 1057 aa  70.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  36.36 
 
 		 873 aa  69.7  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.64 
 
 		 639 aa  68.9  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  41.86 
 
 		 712 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  44.71 
 
 		 713 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.82 
 
 		 1200 aa  67.4  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  39.33 
 
 		 1150 aa  66.6  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5655  collagenase  19.9 
 
 		 878 aa  66.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.123468 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  34.02 
 
 		 861 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0573  PKD domain containing protein  41.18 
 
 		 1084 aa  65.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.179888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.86 
 
 		 945 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 1601 aa  65.1  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  39.25 
 
 		 777 aa  65.1  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  40.91 
 
 		 1916 aa  65.1  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  48.1 
 
 		 823 aa  63.9  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.43 
 
 		 836 aa  63.9  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  32.37 
 
 		 1050 aa  63.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.16 
 
 		 953 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  44.74 
 
 		 1027 aa  63.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  41.86 
 
 		 563 aa  62  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  37.08 
 
 		 1565 aa  62  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  44.93 
 
 		 820 aa  61.2  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  38.3 
 
 		 2066 aa  61.2  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.93 
 
 		 942 aa  60.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  42.68 
 
 		 918 aa  59.7  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  36.9 
 
 		 734 aa  59.7  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.38 
 
 		 699 aa  59.7  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  34.13 
 
 		 596 aa  60.1  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>