115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2754 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1685  collagenase  59.42 
 
 		 968 aa  1121    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  100 
 
 		 972 aa  1999    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  33.99 
 
 		 1005 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3732  collagenase  33.55 
 
 		 1041 aa  436  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0657  collagenase  33.37 
 
 		 1070 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0653  Microbial collagenase  33.48 
 
 		 1041 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0630  collagenase  33.33 
 
 		 1070 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0639  collagenase family protein  30.91 
 
 		 1037 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  30.87 
 
 		 814 aa  360  6e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  31.2 
 
 		 852 aa  332  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2903  Microbial collagenase  33.87 
 
 		 632 aa  323  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.439593 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2230  peptidase  34.29 
 
 		 605 aa  300  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0988  collagenase  31.55 
 
 		 661 aa  299  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244986  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0900  collagenase  31.4 
 
 		 645 aa  299  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0694  putative collagenase  31.66 
 
 		 632 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117227  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1216  collagenase  31.82 
 
 		 645 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000787421  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0773  putative collagenase  31.66 
 
 		 647 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1736  putative collagenase  31.66 
 
 		 645 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1142  collagenase  31.66 
 
 		 647 aa  284  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2419  peptidase  33.57 
 
 		 602 aa  282  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337269  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6876  collagenase  33.39 
 
 		 658 aa  281  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000039324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1578  collagenase, putative  33.04 
 
 		 602 aa  277  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01786  hypothetical protein  27.61 
 
 		 785 aa  244  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001372  microbial collagenase secreted  31.22 
 
 		 808 aa  235  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00032964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0039  collagenase  41.57 
 
 		 590 aa  230  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000449009  normal  0.0513701 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1256  collagenase  39.59 
 
 		 539 aa  229  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029967  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0042  collagenase  42.32 
 
 		 587 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53761  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0616  Microbial collagenase  27.26 
 
 		 787 aa  215  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00460764  normal  0.253983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2966  collagenase  43.66 
 
 		 304 aa  214  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.194174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2743  collagenase  40.37 
 
 		 293 aa  213  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.981604  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3732  collagenase  43.14 
 
 		 603 aa  213  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00527905  hitchhiker  0.00286894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0035  collagenase  47.21 
 
 		 519 aa  213  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2237  collagenase  42.02 
 
 		 667 aa  212  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7152  Peptidase M9A collagenase domain protein  28.73 
 
 		 855 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.766617  normal  0.500432 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1458  collagenase  41.09 
 
 		 322 aa  208  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446603  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3449  collagenase  41 
 
 		 292 aa  206  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3300  collagenase  40.75 
 
 		 294 aa  205  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000170282  decreased coverage  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1517  collagenase  41.02 
 
 		 313 aa  204  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000383276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1077  collagenase  39.62 
 
 		 301 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  0.459952 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00819  hypothetical protein  60.92 
 
 		 823 aa  110  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  57.47 
 
 		 2848 aa  95.5  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  20.66 
 
 		 965 aa  82.8  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  21.08 
 
 		 965 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  20.69 
 
 		 965 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  20.69 
 
 		 965 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  20.84 
 
 		 965 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  20.52 
 
 		 965 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  20.09 
 
 		 965 aa  78.6  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  20.03 
 
 		 965 aa  78.2  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  20.18 
 
 		 965 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  21.04 
 
 		 1104 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  20.78 
 
 		 965 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  38.46 
 
 		 1480 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  21.24 
 
 		 1104 aa  76.3  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  21.76 
 
 		 967 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  21.07 
 
 		 960 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  20.77 
 
 		 960 aa  71.2  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  20.77 
 
 		 960 aa  71.2  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  30.43 
 
 		 553 aa  68.6  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5655  collagenase  27.27 
 
 		 878 aa  67.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.123468 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2821  collagenase  24.4 
 
 		 878 aa  64.3  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.342528  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  26.64 
 
 		 658 aa  62  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3027  microbial collagenase  24.51 
 
 		 878 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  24.74 
 
 		 971 aa  61.2  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2152  thrombospondin type 3 repeat-/CalX-beta domain-containing protein  42.2 
 
 		 1362 aa  60.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  24.74 
 
 		 971 aa  61.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  24.74 
 
 		 1018 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  24.74 
 
 		 971 aa  61.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  25.1 
 
 		 971 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  24.74 
 
 		 971 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  25.1 
 
 		 971 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  24.38 
 
 		 971 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  24.38 
 
 		 971 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  25.79 
 
 		 789 aa  58.5  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  24.38 
 
 		 971 aa  58.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  24.38 
 
 		 789 aa  53.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 		 456 aa  53.1  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.44 
 
 		 629 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.44 
 
 		 629 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.44 
 
 		 629 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.44 
 
 		 629 aa  52.4  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.84 
 
 		 630 aa  51.6  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1325  hypothetical protein  40.48 
 
 		 483 aa  50.8  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000125315 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  40.95 
 
 		 420 aa  50.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.62 
 
 		 447 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  43.02 
 
 		 1987 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.71 
 
 		 807 aa  50.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  39.06 
 
 		 727 aa  50.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  42.55 
 
 		 386 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  41.94 
 
 		 478 aa  49.7  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0876  peptidase domain protein  30.07 
 
 		 843 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 440 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  41.49 
 
 		 386 aa  49.3  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.49 
 
 		 412 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  34.51 
 
 		 623 aa  48.5  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  33.33 
 
 		 609 aa  46.6  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.32 
 
 		 494 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  36 
 
 		 823 aa  47  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 1264 aa  46.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3905  Thrombospondin type 3 repeat protein  36.96 
 
 		 259 aa  46.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>