More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3516 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7152  Peptidase M9A collagenase domain protein  45.95 
 
 		 855 aa  644    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.766617  normal  0.500432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2903  Microbial collagenase  54.62 
 
 		 632 aa  730    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.439593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  100 
 
 		 852 aa  1753    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0616  Microbial collagenase  48.28 
 
 		 787 aa  552  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00460764  normal  0.253983 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0639  collagenase family protein  35.92 
 
 		 1037 aa  487  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  44.24 
 
 		 1005 aa  480  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0657  collagenase  35.37 
 
 		 1070 aa  459  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0653  Microbial collagenase  34.62 
 
 		 1041 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0630  collagenase  34.99 
 
 		 1070 aa  459  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3732  collagenase  34.99 
 
 		 1041 aa  459  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  35.63 
 
 		 814 aa  458  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  31.12 
 
 		 968 aa  365  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0773  putative collagenase  35.58 
 
 		 647 aa  356  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1736  putative collagenase  35.58 
 
 		 645 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0694  putative collagenase  35.58 
 
 		 632 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117227  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1142  collagenase  35.58 
 
 		 647 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1216  collagenase  35.42 
 
 		 645 aa  354  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000787421  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2419  peptidase  35.95 
 
 		 602 aa  354  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337269  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1578  collagenase, putative  35.78 
 
 		 602 aa  353  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  30.65 
 
 		 972 aa  350  5e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6876  collagenase  35.01 
 
 		 658 aa  350  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000039324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0900  collagenase  33.74 
 
 		 645 aa  340  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2230  peptidase  34.64 
 
 		 605 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0988  collagenase  33.59 
 
 		 661 aa  338  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244986  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001372  microbial collagenase secreted  28.99 
 
 		 808 aa  298  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00032964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01786  hypothetical protein  29.41 
 
 		 785 aa  280  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1256  collagenase  32.17 
 
 		 539 aa  251  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029967  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2743  collagenase  41.35 
 
 		 293 aa  213  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.981604  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1077  collagenase  39.15 
 
 		 301 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  0.459952 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2966  collagenase  42.07 
 
 		 304 aa  209  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.194174  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2237  collagenase  38.24 
 
 		 667 aa  207  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971967  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1517  collagenase  39.29 
 
 		 313 aa  207  9e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000383276  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1458  collagenase  40.07 
 
 		 322 aa  197  8.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446603  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3300  collagenase  39.41 
 
 		 294 aa  197  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000170282  decreased coverage  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0042  collagenase  38.21 
 
 		 587 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53761  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3732  collagenase  35.22 
 
 		 603 aa  195  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00527905  hitchhiker  0.00286894 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0039  collagenase  40.35 
 
 		 590 aa  194  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000449009  normal  0.0513701 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3449  collagenase  37.54 
 
 		 292 aa  193  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0035  collagenase  35.94 
 
 		 519 aa  183  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  34.82 
 
 		 823 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  44.06 
 
 		 1565 aa  90.1  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  50 
 
 		 1151 aa  89  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.09 
 
 		 1158 aa  87.8  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  31.79 
 
 		 1027 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  38.52 
 
 		 677 aa  87  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  64.06 
 
 		 818 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  55.56 
 
 		 2066 aa  84.7  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  56.63 
 
 		 1150 aa  82.8  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  52.63 
 
 		 792 aa  82.4  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.43 
 
 		 699 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  23.66 
 
 		 971 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  47.67 
 
 		 948 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  22.86 
 
 		 971 aa  79  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  23 
 
 		 971 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  44.12 
 
 		 967 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  22.49 
 
 		 971 aa  77.8  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  47.67 
 
 		 944 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  40 
 
 		 778 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  40 
 
 		 778 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  40 
 
 		 778 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  47.67 
 
 		 944 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  47.67 
 
 		 944 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  56.52 
 
 		 948 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  22.86 
 
 		 971 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  22.68 
 
 		 971 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  47.67 
 
 		 944 aa  77  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  22.68 
 
 		 971 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  40 
 
 		 778 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.28 
 
 		 836 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  23 
 
 		 971 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  53.12 
 
 		 884 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  43 
 
 		 918 aa  75.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  51.09 
 
 		 712 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  22.83 
 
 		 1018 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  56.72 
 
 		 948 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  23 
 
 		 971 aa  75.1  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  44.94 
 
 		 777 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  51.14 
 
 		 596 aa  74.7  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  47.5 
 
 		 938 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  36.21 
 
 		 965 aa  74.3  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  50.68 
 
 		 775 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.69 
 
 		 835 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  42.86 
 
 		 816 aa  74.3  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  44.83 
 
 		 780 aa  73.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.69 
 
 		 835 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  50 
 
 		 943 aa  73.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  32.41 
 
 		 965 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.75 
 
 		 947 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  40.2 
 
 		 840 aa  72.8  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  48.28 
 
 		 938 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  24.09 
 
 		 1104 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.9 
 
 		 940 aa  72  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.19 
 
 		 944 aa  72  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  52.17 
 
 		 948 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  24.09 
 
 		 1104 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  45.45 
 
 		 623 aa  71.6  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  34.48 
 
 		 965 aa  70.9  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  30.54 
 
 		 965 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  33.62 
 
 		 965 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  36.28 
 
 		 965 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>