268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0162 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  45.89 
 
 		 965 aa  822    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  49.1 
 
 		 971 aa  864    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  45.07 
 
 		 965 aa  812    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  46.61 
 
 		 965 aa  815    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  46.73 
 
 		 960 aa  819    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  48.24 
 
 		 971 aa  863    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  45.51 
 
 		 965 aa  818    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  48.13 
 
 		 971 aa  858    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  45.85 
 
 		 965 aa  818    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  48.87 
 
 		 1018 aa  862    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  45.05 
 
 		 960 aa  810    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5655  collagenase  48.94 
 
 		 878 aa  715    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.123468 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3027  microbial collagenase  49.72 
 
 		 878 aa  721    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2821  collagenase  50.28 
 
 		 878 aa  727    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.342528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  45.4 
 
 		 965 aa  819    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  48.76 
 
 		 971 aa  870    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  49.21 
 
 		 971 aa  867    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  48.24 
 
 		 971 aa  862    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  48.99 
 
 		 971 aa  859    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  46.52 
 
 		 967 aa  860    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  46.61 
 
 		 965 aa  815    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  46.73 
 
 		 960 aa  819    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  48.24 
 
 		 971 aa  863    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  49.1 
 
 		 971 aa  863    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  98.55 
 
 		 1104 aa  2206    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  100 
 
 		 1104 aa  2241    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  46.27 
 
 		 965 aa  810    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  45.78 
 
 		 965 aa  818    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  45.35 
 
 		 965 aa  812    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3861  serine protease, subtilase family  43.36 
 
 		 613 aa  94.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1437  serine protease, subtilase family  42.48 
 
 		 613 aa  92.4  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000606827  hitchhiker  0.00102573 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3514  serine protease  42.48 
 
 		 613 aa  91.3  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3605  serine protease  41.59 
 
 		 613 aa  90.1  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3502  serine protease  41.59 
 
 		 613 aa  90.1  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000122382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3892  serine protease  41.59 
 
 		 613 aa  90.1  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000928217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3772  serine protease, subtilase family  41.59 
 
 		 613 aa  90.1  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000373923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3794  serine protease  40.71 
 
 		 613 aa  88.2  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000410497  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3732  collagenase  22.97 
 
 		 1041 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0630  collagenase  23.01 
 
 		 1070 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0653  Microbial collagenase  23.01 
 
 		 1041 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0657  collagenase  22.84 
 
 		 1070 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1697  peptidase M9A collagenase domain-containing protein  41.9 
 
 		 554 aa  81.6  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367258  hitchhiker  0.00906719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0639  collagenase family protein  22.04 
 
 		 1037 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2230  peptidase  29.3 
 
 		 605 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0900  collagenase  29.3 
 
 		 645 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6876  collagenase  26.74 
 
 		 658 aa  79.7  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000039324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0988  collagenase  29.3 
 
 		 661 aa  79.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244986  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1418  hypothetical protein  39.42 
 
 		 552 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0422281  normal  0.0166788 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1578  collagenase, putative  26.5 
 
 		 602 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  21.24 
 
 		 972 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  38.38 
 
 		 1057 aa  77  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0694  putative collagenase  25.26 
 
 		 632 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117227  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2419  peptidase  25.26 
 
 		 602 aa  75.5  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337269  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0773  putative collagenase  25.26 
 
 		 647 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1736  putative collagenase  25.26 
 
 		 645 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1216  collagenase  25.26 
 
 		 645 aa  74.7  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000787421  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1142  collagenase  25.26 
 
 		 647 aa  74.7  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2237  collagenase  28.44 
 
 		 667 aa  74.3  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  24.03 
 
 		 852 aa  74.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01786  hypothetical protein  23.4 
 
 		 785 aa  73.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  21.79 
 
 		 968 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  39.77 
 
 		 943 aa  73.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  28.08 
 
 		 1916 aa  72.8  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0039  collagenase  23.73 
 
 		 590 aa  72.8  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000449009  normal  0.0513701 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.53 
 
 		 639 aa  72.8  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  42.35 
 
 		 623 aa  71.6  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  40.23 
 
 		 816 aa  70.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  20.3 
 
 		 814 aa  70.5  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  32.12 
 
 		 1150 aa  71.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  34.11 
 
 		 1565 aa  70.1  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  36.17 
 
 		 884 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  43.08 
 
 		 2066 aa  68.9  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  37.21 
 
 		 1050 aa  68.9  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  32.82 
 
 		 873 aa  68.9  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.81 
 
 		 6885 aa  67.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  25.86 
 
 		 1005 aa  67  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1517  collagenase  27.41 
 
 		 313 aa  67  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000383276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0035  collagenase  26.01 
 
 		 519 aa  66.2  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0042  collagenase  22.82 
 
 		 587 aa  66.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53761  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  41.67 
 
 		 792 aa  65.5  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  31.45 
 
 		 820 aa  65.5  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.04 
 
 		 940 aa  65.1  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0872  peptidase M9A collagenase domain-containing protein  27.64 
 
 		 565 aa  65.1  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0507103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  43.42 
 
 		 713 aa  64.3  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  36.67 
 
 		 734 aa  64.3  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  38.37 
 
 		 861 aa  64.3  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  31.03 
 
 		 823 aa  64.3  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  33.85 
 
 		 675 aa  63.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  41.11 
 
 		 1601 aa  63.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  48.28 
 
 		 1151 aa  63.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001372  microbial collagenase secreted  20.83 
 
 		 808 aa  62.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00032964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  33.33 
 
 		 712 aa  62.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  30.69 
 
 		 677 aa  63.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  27.82 
 
 		 777 aa  63.2  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  44.44 
 
 		 596 aa  61.6  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.42 
 
 		 942 aa  60.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.45 
 
 		 955 aa  61.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  33.9 
 
 		 775 aa  60.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3732  collagenase  33.33 
 
 		 603 aa  60.1  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00527905  hitchhiker  0.00286894 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  49.21 
 
 		 918 aa  60.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>