210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7152 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7152  Peptidase M9A collagenase domain protein  100 
 
 		 855 aa  1726    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.766617  normal  0.500432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  46.7 
 
 		 852 aa  618  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0616  Microbial collagenase  50.23 
 
 		 787 aa  617  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00460764  normal  0.253983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2903  Microbial collagenase  40.62 
 
 		 632 aa  462  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.439593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  31.41 
 
 		 1005 aa  324  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0639  collagenase family protein  29.78 
 
 		 1037 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0630  collagenase  30.12 
 
 		 1070 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  28.96 
 
 		 814 aa  303  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3732  collagenase  29.99 
 
 		 1041 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0653  Microbial collagenase  29.99 
 
 		 1041 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0657  collagenase  29.72 
 
 		 1070 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  27.88 
 
 		 968 aa  282  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0773  putative collagenase  32.71 
 
 		 647 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1216  collagenase  32.71 
 
 		 645 aa  252  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000787421  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2419  peptidase  32.71 
 
 		 602 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337269  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1736  putative collagenase  32.71 
 
 		 645 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1142  collagenase  32.71 
 
 		 647 aa  252  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0694  putative collagenase  32.71 
 
 		 632 aa  250  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117227  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1578  collagenase, putative  32.48 
 
 		 602 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0900  collagenase  31.86 
 
 		 645 aa  244  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2230  peptidase  31.86 
 
 		 605 aa  243  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6876  collagenase  30.8 
 
 		 658 aa  243  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000039324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0988  collagenase  31.86 
 
 		 661 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244986  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  28.73 
 
 		 972 aa  218  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001372  microbial collagenase secreted  26.18 
 
 		 808 aa  209  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00032964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01786  hypothetical protein  28.57 
 
 		 785 aa  191  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1256  collagenase  29.4 
 
 		 539 aa  184  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029967  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2743  collagenase  37.04 
 
 		 293 aa  161  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.981604  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1458  collagenase  34.72 
 
 		 322 aa  154  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446603  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3449  collagenase  35.42 
 
 		 292 aa  154  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2966  collagenase  37.13 
 
 		 304 aa  151  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.194174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0039  collagenase  34.66 
 
 		 590 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000449009  normal  0.0513701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1077  collagenase  34.34 
 
 		 301 aa  146  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  0.459952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2237  collagenase  34.78 
 
 		 667 aa  144  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971967  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0042  collagenase  33.47 
 
 		 587 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53761  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3300  collagenase  34.2 
 
 		 294 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000170282  decreased coverage  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3732  collagenase  33.06 
 
 		 603 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00527905  hitchhiker  0.00286894 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1517  collagenase  33.2 
 
 		 313 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000383276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0035  collagenase  31.27 
 
 		 519 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.24 
 
 		 1158 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.3 
 
 		 699 aa  65.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.12 
 
 		 835 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.12 
 
 		 835 aa  65.1  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  42.17 
 
 		 1565 aa  64.3  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.05 
 
 		 836 aa  62  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  37.78 
 
 		 944 aa  62.4  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  37.78 
 
 		 944 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  37.78 
 
 		 944 aa  62  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  42.68 
 
 		 818 aa  61.2  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  39.36 
 
 		 945 aa  61.2  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  36.67 
 
 		 944 aa  60.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  37.76 
 
 		 948 aa  59.7  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  42.35 
 
 		 938 aa  60.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  38.78 
 
 		 1916 aa  58.9  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 658 aa  58.9  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  37.37 
 
 		 560 aa  58.5  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  38.78 
 
 		 861 aa  58.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.67 
 
 		 944 aa  58.5  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  38.83 
 
 		 713 aa  57.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  44.12 
 
 		 3295 aa  57.4  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  30.6 
 
 		 1862 aa  57.4  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  43.88 
 
 		 2066 aa  57.4  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  33.79 
 
 		 930 aa  56.2  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  29.73 
 
 		 553 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  33.33 
 
 		 1094 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  41.05 
 
 		 658 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  41.05 
 
 		 675 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  40.45 
 
 		 861 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  25.61 
 
 		 823 aa  55.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  33.12 
 
 		 561 aa  55.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  37.86 
 
 		 679 aa  55.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.9 
 
 		 579 aa  55.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  36.56 
 
 		 918 aa  54.7  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  28.12 
 
 		 840 aa  54.7  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  40.66 
 
 		 669 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.67 
 
 		 494 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  36.89 
 
 		 685 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  41.86 
 
 		 644 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  34.35 
 
 		 1969 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  29.7 
 
 		 2176 aa  53.5  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  34.27 
 
 		 963 aa  53.5  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  35.29 
 
 		 677 aa  53.5  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  42.72 
 
 		 2554 aa  52.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  36.84 
 
 		 929 aa  52.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  41.43 
 
 		 948 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  34.52 
 
 		 1027 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  42.17 
 
 		 791 aa  52  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  19.51 
 
 		 965 aa  52  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  36.51 
 
 		 1387 aa  52  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.93 
 
 		 835 aa  52  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  18.1 
 
 		 965 aa  51.6  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  38.74 
 
 		 1667 aa  51.2  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  41.12 
 
 		 1732 aa  51.6  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  36.73 
 
 		 935 aa  51.2  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  39.05 
 
 		 1361 aa  51.2  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.67 
 
 		 940 aa  51.2  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  36.36 
 
 		 581 aa  51.2  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  40.66 
 
 		 735 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  29.46 
 
 		 558 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1667 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>