79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0639 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  63.54 
 
 		 1005 aa  1377    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0630  collagenase  74.9 
 
 		 1070 aa  1615    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0657  collagenase  74.71 
 
 		 1070 aa  1609    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0653  Microbial collagenase  75.19 
 
 		 1041 aa  1617    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0639  collagenase family protein  100 
 
 		 1037 aa  2143    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3732  collagenase  74.9 
 
 		 1041 aa  1610    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  44.89 
 
 		 852 aa  476  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2903  Microbial collagenase  38.35 
 
 		 632 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.439593 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  34.45 
 
 		 968 aa  433  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  30.45 
 
 		 972 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0616  Microbial collagenase  35.37 
 
 		 787 aa  338  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00460764  normal  0.253983 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  31.29 
 
 		 814 aa  335  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1736  putative collagenase  34.65 
 
 		 645 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0773  putative collagenase  34.65 
 
 		 647 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0694  putative collagenase  34.65 
 
 		 632 aa  331  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117227  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1142  collagenase  34.65 
 
 		 647 aa  331  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1216  collagenase  35.09 
 
 		 645 aa  330  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000787421  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2419  peptidase  34.9 
 
 		 602 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337269  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6876  collagenase  33.99 
 
 		 658 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000039324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0988  collagenase  33.66 
 
 		 661 aa  327  6e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244986  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1578  collagenase, putative  34.63 
 
 		 602 aa  327  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0900  collagenase  33.39 
 
 		 645 aa  326  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2230  peptidase  33.89 
 
 		 605 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7152  Peptidase M9A collagenase domain protein  29.77 
 
 		 855 aa  307  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.766617  normal  0.500432 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01786  hypothetical protein  32.44 
 
 		 785 aa  274  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001372  microbial collagenase secreted  30.58 
 
 		 808 aa  273  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00032964  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1077  collagenase  43.75 
 
 		 301 aa  231  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  0.459952 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1256  collagenase  41.81 
 
 		 539 aa  229  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029967  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0042  collagenase  43.82 
 
 		 587 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53761  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2966  collagenase  44.75 
 
 		 304 aa  217  8e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.194174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3732  collagenase  40.22 
 
 		 603 aa  217  9e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00527905  hitchhiker  0.00286894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3449  collagenase  42.69 
 
 		 292 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2743  collagenase  41.86 
 
 		 293 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.981604  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1517  collagenase  40.44 
 
 		 313 aa  214  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000383276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3300  collagenase  41 
 
 		 294 aa  209  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000170282  decreased coverage  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2237  collagenase  43.09 
 
 		 667 aa  208  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0035  collagenase  40.91 
 
 		 519 aa  206  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1458  collagenase  40.68 
 
 		 322 aa  206  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446603  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0039  collagenase  38.68 
 
 		 590 aa  206  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000449009  normal  0.0513701 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  23.75 
 
 		 971 aa  87.8  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  23.75 
 
 		 971 aa  87.8  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  23.53 
 
 		 1018 aa  84.7  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  23.03 
 
 		 971 aa  84.7  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  23.53 
 
 		 971 aa  84.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  21.48 
 
 		 971 aa  82.4  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  22.93 
 
 		 971 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  22.22 
 
 		 971 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  21.3 
 
 		 971 aa  80.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  22.04 
 
 		 1104 aa  79.7  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  21.32 
 
 		 971 aa  79.3  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  21.25 
 
 		 1104 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3027  microbial collagenase  21.23 
 
 		 878 aa  76.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2821  collagenase  20.42 
 
 		 878 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.342528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  19.89 
 
 		 965 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  20.47 
 
 		 965 aa  71.2  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  20.32 
 
 		 965 aa  71.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  20.32 
 
 		 965 aa  71.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  21.19 
 
 		 965 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  20.59 
 
 		 967 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  21.19 
 
 		 965 aa  71.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  21.19 
 
 		 965 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  20.58 
 
 		 965 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5655  collagenase  20.7 
 
 		 878 aa  68.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.123468 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  21.27 
 
 		 965 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  19.79 
 
 		 965 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  20.25 
 
 		 960 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  25.64 
 
 		 960 aa  62  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  25.64 
 
 		 960 aa  62  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  25.53 
 
 		 658 aa  58.5  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.96 
 
 		 629 aa  58.2  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.96 
 
 		 629 aa  58.2  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.02 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.96 
 
 		 629 aa  57.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.49 
 
 		 629 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  24.51 
 
 		 553 aa  46.6  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1255  collagenase  23.47 
 
 		 252 aa  46.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048292  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  24.75 
 
 		 789 aa  46.2  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  24.5 
 
 		 789 aa  45.8  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.14 
 
 		 630 aa  45.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>