148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4257 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  69.35 
 
 
542 aa  806    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  100 
 
 
558 aa  1147    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  65.19 
 
 
553 aa  704    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  98.57 
 
 
558 aa  1134    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  64.5 
 
 
539 aa  739    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  53.53 
 
 
1310 aa  260  5.0000000000000005e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  54.36 
 
 
1346 aa  256  9e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1877  Endonuclease I  55.17 
 
 
388 aa  253  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  52.82 
 
 
1503 aa  252  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  55.6 
 
 
275 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  55.6 
 
 
275 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  55.6 
 
 
275 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  54.31 
 
 
275 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  53.88 
 
 
275 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  54.51 
 
 
256 aa  240  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1682  Endonuclease I  46.55 
 
 
267 aa  202  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  46.32 
 
 
378 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  40.22 
 
 
285 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0543  endonuclease I  37.08 
 
 
466 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3628  Endonuclease I  34.56 
 
 
596 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6326  Endonuclease I  35.29 
 
 
442 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.95 
 
 
807 aa  125  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 
807 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  34.24 
 
 
657 aa  121  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  43.33 
 
 
658 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.92 
 
 
802 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  50.42 
 
 
807 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.39 
 
 
818 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.92 
 
 
819 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.31 
 
 
805 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.31 
 
 
805 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.31 
 
 
809 aa  117  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.15 
 
 
819 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.15 
 
 
819 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.15 
 
 
819 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  52.34 
 
 
553 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.57 
 
 
803 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  34.77 
 
 
538 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  55.42 
 
 
789 aa  110  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.15 
 
 
823 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  52.13 
 
 
803 aa  109  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  33.58 
 
 
539 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  31.15 
 
 
365 aa  104  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.74 
 
 
494 aa  104  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  32.67 
 
 
614 aa  103  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  43.36 
 
 
789 aa  101  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  33.63 
 
 
272 aa  100  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  32.69 
 
 
617 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.88 
 
 
630 aa  100  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47 
 
 
579 aa  98.6  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  44 
 
 
775 aa  97.1  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  46.74 
 
 
777 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  47.25 
 
 
778 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  44.76 
 
 
794 aa  95.9  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  47.78 
 
 
778 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  46.15 
 
 
778 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  47.78 
 
 
778 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.52 
 
 
629 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  42.59 
 
 
774 aa  91.3  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.66 
 
 
629 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  47.78 
 
 
534 aa  90.1  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.67 
 
 
629 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  50 
 
 
489 aa  90.1  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.66 
 
 
629 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.46 
 
 
628 aa  89.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.27 
 
 
520 aa  89  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  45.68 
 
 
533 aa  86.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  38.52 
 
 
560 aa  85.1  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  38.84 
 
 
677 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48915  predicted protein  31.15 
 
 
516 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  33.33 
 
 
823 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  41.07 
 
 
476 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  35.44 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  36.94 
 
 
501 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  36.27 
 
 
701 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  34.03 
 
 
232 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  41.11 
 
 
535 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  37.84 
 
 
609 aa  73.9  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf874  membrane nuclease  31.1 
 
 
314 aa  69.3  0.0000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02448  protease  33.94 
 
 
482 aa  67.4  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2748  endonuclease I  31.62 
 
 
211 aa  62.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2569  deoxyribonuclease I  34.31 
 
 
321 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0107726  normal  0.160045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  32.58 
 
 
219 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  33.33 
 
 
504 aa  60.5  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  32.14 
 
 
311 aa  59.7  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5708  peptidase domain protein  37.18 
 
 
492 aa  58.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3757  deoxyribonuclease I  31.25 
 
 
323 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163237  normal  0.488138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3375  deoxyribonuclease I  31.62 
 
 
321 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2383  deoxyribonuclease I  31.62 
 
 
321 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178356  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3349  deoxyribonuclease I  31.01 
 
 
235 aa  55.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000315843  decreased coverage  0.00212113 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01786  hypothetical protein  31.75 
 
 
785 aa  54.7  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1309  deoxyribonuclease I  34.88 
 
 
229 aa  54.3  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122078  normal  0.128017 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0547  Deoxyribonuclease I  30.53 
 
 
232 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000480912  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3907  Deoxyribonuclease I  32.06 
 
 
232 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02674  protease  35.23 
 
 
176 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2835  deoxyribonuclease I  35.66 
 
 
229 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.667244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0504  Deoxyribonuclease I  31.3 
 
 
233 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  29.01 
 
 
1005 aa  52.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  29.35 
 
 
780 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3709  Deoxyribonuclease I  28.41 
 
 
232 aa  52  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>