38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1893 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  100 
 
 
2632 aa  5264    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  49.69 
 
 
2334 aa  588  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  35.57 
 
 
3193 aa  539  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  36.61 
 
 
863 aa  369  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  35.74 
 
 
1156 aa  364  9e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  35.33 
 
 
1594 aa  362  4e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1636  peptidase  33.21 
 
 
800 aa  354  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  39.86 
 
 
715 aa  235  9e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4303  peptidase-like  33.95 
 
 
1289 aa  163  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0594037  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  36.67 
 
 
2062 aa  123  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1886  peptidase  29.23 
 
 
827 aa  102  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  37.13 
 
 
6109 aa  99.4  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 
2030 aa  94.4  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  32.57 
 
 
1748 aa  89.4  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2544  APHP domain protein  31.51 
 
 
405 aa  86.7  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.06 
 
 
1225 aa  82.8  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3082  peptidase domain protein  26.04 
 
 
539 aa  82.8  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  32.52 
 
 
995 aa  80.5  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0498  APHP  27.92 
 
 
545 aa  79.7  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0698574  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.87 
 
 
891 aa  77.8  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.13 
 
 
1222 aa  75.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.68 
 
 
1012 aa  73.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.46 
 
 
1113 aa  71.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.23 
 
 
1454 aa  71.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.68 
 
 
1118 aa  70.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.59 
 
 
1009 aa  70.1  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  31.19 
 
 
1613 aa  69.7  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.79 
 
 
1340 aa  67  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.96 
 
 
2194 aa  66.6  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1649  peptidase-like  41.49 
 
 
167 aa  65.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.165499  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.95 
 
 
953 aa  64.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000882401  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  36.57 
 
 
663 aa  63.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.57 
 
 
627 aa  62.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1936  APHP domain protein  26.98 
 
 
1074 aa  55.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620471  normal  0.229187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2450  APHP  30.63 
 
 
1619 aa  54.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  27.03 
 
 
495 aa  52  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  32.32 
 
 
620 aa  52  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.25 
 
 
1726 aa  46.6  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>