More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4572 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  100 
 
 
995 aa  2005    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  55.92 
 
 
2194 aa  395  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  52.13 
 
 
2062 aa  382  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4303  peptidase-like  41.76 
 
 
1289 aa  342  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0594037  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1636  peptidase  27.37 
 
 
800 aa  194  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  22.97 
 
 
2632 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  32.24 
 
 
2334 aa  93.2  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  33.01 
 
 
715 aa  92  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  31.09 
 
 
268 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  30.67 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  35.14 
 
 
281 aa  84  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  34.38 
 
 
298 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  37.31 
 
 
299 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  41.32 
 
 
319 aa  82  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  27.54 
 
 
863 aa  82  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  34.44 
 
 
293 aa  80.9  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  37.23 
 
 
299 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  35.14 
 
 
298 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  33.33 
 
 
300 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  35.14 
 
 
298 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  37.33 
 
 
298 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  36.23 
 
 
298 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  47.13 
 
 
1594 aa  76.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1689  peptidase M23B  35.71 
 
 
261 aa  75.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.28 
 
 
1143 aa  74.7  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  29.2 
 
 
3193 aa  74.7  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1886  peptidase  39.47 
 
 
827 aa  74.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  41.8 
 
 
387 aa  73.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  36.17 
 
 
297 aa  72  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1649  peptidase-like  39.36 
 
 
167 aa  71.6  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.165499  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  33.56 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  26.67 
 
 
1063 aa  71.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  35.77 
 
 
695 aa  70.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  38.46 
 
 
681 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  33.79 
 
 
290 aa  69.3  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  38.46 
 
 
676 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  33.79 
 
 
290 aa  69.3  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  29.08 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  39.39 
 
 
697 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  35.94 
 
 
646 aa  67  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  39.39 
 
 
697 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  39.39 
 
 
699 aa  67  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  31.14 
 
 
1156 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  24.05 
 
 
619 aa  65.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.28 
 
 
326 aa  65.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  38.38 
 
 
674 aa  65.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  34.16 
 
 
300 aa  65.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  41.57 
 
 
482 aa  65.1  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  32 
 
 
687 aa  65.1  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  40 
 
 
439 aa  64.7  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.17 
 
 
891 aa  64.7  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  36.11 
 
 
754 aa  64.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  36.73 
 
 
465 aa  63.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  49.15 
 
 
656 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  38.61 
 
 
621 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  37.86 
 
 
824 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  29.92 
 
 
312 aa  62.8  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  36.45 
 
 
683 aa  62.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  31.25 
 
 
533 aa  62.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  33.33 
 
 
665 aa  62.8  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.69 
 
 
343 aa  62.4  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  32.84 
 
 
569 aa  62.4  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  38.78 
 
 
615 aa  62.4  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  31.91 
 
 
331 aa  62.4  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  50.85 
 
 
384 aa  62.4  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  32.37 
 
 
301 aa  62.4  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  51.79 
 
 
382 aa  62.4  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  37.89 
 
 
286 aa  62  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  46.55 
 
 
325 aa  62  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  34.64 
 
 
425 aa  62  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  35.88 
 
 
482 aa  62  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  33.33 
 
 
412 aa  62  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  46.55 
 
 
386 aa  61.6  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  37.36 
 
 
438 aa  61.6  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  46.55 
 
 
386 aa  61.6  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  46.55 
 
 
386 aa  61.6  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  32.2 
 
 
695 aa  61.6  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  46.03 
 
 
597 aa  61.6  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  42.65 
 
 
287 aa  61.6  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  34.02 
 
 
477 aa  61.6  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  34.02 
 
 
477 aa  61.2  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  37.86 
 
 
346 aa  61.6  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  34.26 
 
 
324 aa  61.2  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  30.77 
 
 
676 aa  60.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.71 
 
 
441 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  33.61 
 
 
304 aa  60.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  34.26 
 
 
460 aa  60.8  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  22.57 
 
 
4689 aa  60.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  34.64 
 
 
425 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.28 
 
 
1009 aa  61.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  44.44 
 
 
592 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  31.62 
 
 
470 aa  60.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  42.65 
 
 
315 aa  60.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  36.84 
 
 
452 aa  59.7  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  40 
 
 
491 aa  60.1  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  33.59 
 
 
458 aa  59.7  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  34.53 
 
 
457 aa  60.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  34.53 
 
 
457 aa  60.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  32.14 
 
 
399 aa  59.7  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  32.14 
 
 
399 aa  60.1  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>