16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1649 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1649  peptidase-like  100 
 
 
167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.165499  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  49.21 
 
 
2062 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4303  peptidase-like  47.66 
 
 
1289 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0594037  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  41.49 
 
 
2632 aa  65.1  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  30.57 
 
 
1594 aa  64.3  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  30.72 
 
 
1156 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1636  peptidase  35.71 
 
 
800 aa  58.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  42.27 
 
 
715 aa  58.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  43.9 
 
 
2334 aa  58.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  41.35 
 
 
863 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.4 
 
 
891 aa  54.7  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.36 
 
 
1009 aa  52  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  39.36 
 
 
995 aa  51.6  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  38.71 
 
 
663 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1886  peptidase  31.52 
 
 
827 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0783  peptidase-like  30.99 
 
 
451 aa  40.8  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.888288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>