43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4303 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4303  peptidase-like  100 
 
 		 1289 aa  2575    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0594037  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  54.12 
 
 		 2062 aa  606  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  55.21 
 
 		 2194 aa  509  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  44.82 
 
 		 995 aa  293  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.83 
 
 		 768 aa  178  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1636  peptidase  33.14 
 
 		 800 aa  171  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  33.95 
 
 		 2632 aa  163  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50 
 
 		 1269 aa  148  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50 
 
 		 1269 aa  148  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  35.76 
 
 		 2334 aa  130  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  32.66 
 
 		 715 aa  129  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.94 
 
 		 3193 aa  128  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.91 
 
 		 928 aa  113  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  33.23 
 
 		 1156 aa  112  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  29.65 
 
 		 1594 aa  108  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  27.42 
 
 		 863 aa  103  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  27.81 
 
 		 648 aa  99.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1649  peptidase-like  47.66 
 
 		 167 aa  95.9  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.165499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  30.77 
 
 		 745 aa  90.9  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1886  peptidase  23.22 
 
 		 827 aa  80.1  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.22 
 
 		 1143 aa  70.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  27.15 
 
 		 4689 aa  65.5  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  28.12 
 
 		 681 aa  63.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  30.91 
 
 		 1134 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  25.87 
 
 		 1063 aa  60.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  25.94 
 
 		 619 aa  58.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  25.89 
 
 		 713 aa  57.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  30.22 
 
 		 535 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  26.43 
 
 		 713 aa  55.1  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  28.65 
 
 		 513 aa  55.1  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3082  peptidase domain protein  22.41 
 
 		 539 aa  53.5  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0783  peptidase-like  27.44 
 
 		 451 aa  52.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  40 
 
 		 1133 aa  52  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  30.92 
 
 		 535 aa  52  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  24.47 
 
 		 4214 aa  50.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  31.03 
 
 		 373 aa  50.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2955  hypothetical protein  26.44 
 
 		 391 aa  48.5  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00044648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  34.06 
 
 		 727 aa  48.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  39.51 
 
 		 663 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0657  collagenase  23.54 
 
 		 1070 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.7 
 
 		 891 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  39.29 
 
 		 421 aa  46.6  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  28.3 
 
 		 490 aa  46.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>