More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0616 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  100 
 
 
745 aa  1476    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  64.64 
 
 
648 aa  723    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  48.43 
 
 
1544 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  43.67 
 
 
2911 aa  220  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  30.99 
 
 
1134 aa  211  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  29.57 
 
 
1133 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  39.86 
 
 
1079 aa  193  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.91 
 
 
2678 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  38.19 
 
 
833 aa  180  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  40.36 
 
 
1884 aa  177  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  32.24 
 
 
727 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  36.45 
 
 
556 aa  172  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  40.41 
 
 
759 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  31.21 
 
 
2097 aa  167  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  30.7 
 
 
1112 aa  164  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  40.78 
 
 
1145 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  40.23 
 
 
2836 aa  160  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  43.12 
 
 
1390 aa  159  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 
4800 aa  158  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  32.9 
 
 
535 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  42.77 
 
 
1424 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  38.79 
 
 
1112 aa  154  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  31.83 
 
 
535 aa  153  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  30.97 
 
 
1610 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  31.16 
 
 
504 aa  147  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  34.15 
 
 
2133 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  36.13 
 
 
481 aa  143  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  33.08 
 
 
946 aa  143  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  29.85 
 
 
820 aa  143  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.59 
 
 
1236 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  36.67 
 
 
2775 aa  142  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  32.79 
 
 
486 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  32.51 
 
 
476 aa  141  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  33.51 
 
 
478 aa  140  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  33.07 
 
 
513 aa  140  7e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  30.89 
 
 
1628 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  32.23 
 
 
474 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  35.92 
 
 
1279 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  37.28 
 
 
1582 aa  138  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  32.46 
 
 
476 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  34.79 
 
 
2198 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  31.98 
 
 
475 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  34.19 
 
 
1072 aa  136  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  33.49 
 
 
1213 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  32.78 
 
 
480 aa  134  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  30.56 
 
 
490 aa  134  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  33.69 
 
 
1534 aa  132  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  32.26 
 
 
1610 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  31.23 
 
 
1864 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  31.25 
 
 
479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  32.88 
 
 
3209 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  30.33 
 
 
768 aa  128  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  32.86 
 
 
2954 aa  127  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  40.96 
 
 
677 aa  127  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  33.73 
 
 
1164 aa  127  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  37.82 
 
 
1883 aa  126  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  30.62 
 
 
468 aa  126  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  31.76 
 
 
1400 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  39.07 
 
 
4687 aa  123  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  34.23 
 
 
785 aa  122  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  37.57 
 
 
2105 aa  120  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  38.25 
 
 
2567 aa  120  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  31.26 
 
 
764 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  34.4 
 
 
833 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  31.05 
 
 
479 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  32.79 
 
 
526 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  48.25 
 
 
486 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  31.25 
 
 
3954 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.95 
 
 
1269 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.71 
 
 
1795 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.95 
 
 
1269 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  32.77 
 
 
795 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  31.49 
 
 
1286 aa  115  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  34.49 
 
 
595 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  37.19 
 
 
4334 aa  114  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  30.33 
 
 
574 aa  114  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.22 
 
 
3427 aa  114  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  31.94 
 
 
444 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  31.55 
 
 
442 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  31.55 
 
 
444 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  29.21 
 
 
713 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  32.9 
 
 
1712 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  29.37 
 
 
713 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  33.49 
 
 
3619 aa  111  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  34.01 
 
 
2701 aa  110  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  33.16 
 
 
1855 aa  110  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  33.33 
 
 
1363 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  34.37 
 
 
965 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  29.64 
 
 
2467 aa  110  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.49 
 
 
1180 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.75 
 
 
768 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  32.81 
 
 
1895 aa  108  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  37.08 
 
 
2667 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  31.09 
 
 
621 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  31.09 
 
 
621 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  30.83 
 
 
1532 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  34.2 
 
 
3619 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  33.69 
 
 
615 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  44.44 
 
 
2887 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  29.15 
 
 
2807 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>