14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2955 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2955  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  807    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00044648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3334  hypothetical protein  32.12 
 
 		 257 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.59857  hitchhiker  0.00275482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7127  hypothetical protein  32.19 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6184  hypothetical protein  28.96 
 
 		 250 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0174  hypothetical protein  27.35 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2356  hypothetical protein  26.94 
 
 		 496 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6262  protease B  24.29 
 
 		 277 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0777817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  24.35 
 
 		 425 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4303  peptidase-like  26.44 
 
 		 1289 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0594037  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1313  hypothetical protein  25 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.805191 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 		 571 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4241  hypothetical protein  24.83 
 
 		 276 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  36.73 
 
 		 800 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  36.63 
 
 		 802 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>