11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3334 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3334  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  534  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.59857  hitchhiker  0.00275482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2955  hypothetical protein  32.12 
 
 		 391 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00044648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7127  hypothetical protein  31.11 
 
 		 403 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2356  hypothetical protein  31.53 
 
 		 496 aa  92.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6184  hypothetical protein  25.9 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  26.88 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4241  hypothetical protein  28.11 
 
 		 276 aa  72  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1313  hypothetical protein  28.63 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.805191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6262  protease B  24.07 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0777817 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13468  hypothetical protein  28.37 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0174  hypothetical protein  21.56 
 
 		 381 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>