11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6262 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6262  protease B  100 
 
 		 277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0777817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1313  hypothetical protein  55 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.805191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  49.29 
 
 		 425 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4241  hypothetical protein  44.6 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13468  hypothetical protein  39.93 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7127  hypothetical protein  30.63 
 
 		 403 aa  85.9  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0174  hypothetical protein  27.4 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3334  hypothetical protein  23.97 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.59857  hitchhiker  0.00275482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6184  hypothetical protein  27.99 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2955  hypothetical protein  25.17 
 
 		 391 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00044648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2356  hypothetical protein  23.16 
 
 		 496 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>