26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7127 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7127  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  832    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6184  hypothetical protein  44.31 
 
 
250 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2955  hypothetical protein  32.19 
 
 
391 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00044648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3334  hypothetical protein  31.11 
 
 
257 aa  109  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.59857  hitchhiker  0.00275482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  32.37 
 
 
425 aa  99.8  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6262  protease B  31.7 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0777817 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  36.08 
 
 
633 aa  79.7  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.37 
 
 
693 aa  76.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1313  hypothetical protein  27.1 
 
 
334 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.805191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4241  hypothetical protein  27.05 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  36.05 
 
 
514 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  38.02 
 
 
815 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  36.73 
 
 
269 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0174  hypothetical protein  25.52 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  35.92 
 
 
324 aa  61.6  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  35.37 
 
 
808 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  35 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13468  hypothetical protein  36.29 
 
 
284 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1215  membrane attack complex component/perforin/complement C9  33.33 
 
 
466 aa  58.9  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.18029  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  34.15 
 
 
595 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  32.17 
 
 
643 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.87 
 
 
606 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.98 
 
 
638 aa  47.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2356  hypothetical protein  23.84 
 
 
496 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1681  Zn-dependent protease  31.19 
 
 
214 aa  43.1  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493687 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3162  hypothetical protein  27.87 
 
 
1188 aa  43.1  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11605  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>