25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0009 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  668    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  56.72 
 
 		 416 aa  159  7e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  54.74 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0897  hypothetical protein  50.68 
 
 		 483 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1519  hypothetical protein  49.32 
 
 		 176 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00366032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  47.86 
 
 		 207 aa  123  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0651  surface antigen  47.83 
 
 		 232 aa  123  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1630  surface antigen  48.18 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000382803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1708  surface antigen  45.14 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.63868  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  45.59 
 
 		 303 aa  112  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0110  surface antigen  47.37 
 
 		 152 aa  106  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1614  surface antigen  46.53 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000315849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  36.31 
 
 		 815 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  34.72 
 
 		 808 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  34.93 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  32.12 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  33.33 
 
 		 643 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 606 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.1 
 
 		 693 aa  69.7  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  32.64 
 
 		 514 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  40 
 
 		 633 aa  67  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  33.59 
 
 		 595 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7127  hypothetical protein  35.92 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32 
 
 		 638 aa  59.7  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1215  membrane attack complex component/perforin/complement C9  31.03 
 
 		 466 aa  47  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.18029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>