25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0223 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  100 
 
 
207 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0651  surface antigen  70.21 
 
 
232 aa  206  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  68.18 
 
 
303 aa  195  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1630  surface antigen  68.94 
 
 
290 aa  188  5.999999999999999e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000382803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1708  surface antigen  62.59 
 
 
256 aa  181  8.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.63868  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0110  surface antigen  63.06 
 
 
152 aa  153  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1614  surface antigen  62.24 
 
 
144 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000315849  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  49.3 
 
 
377 aa  129  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  47.86 
 
 
324 aa  123  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  41.55 
 
 
416 aa  116  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1519  hypothetical protein  41.96 
 
 
176 aa  106  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00366032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0897  hypothetical protein  42.34 
 
 
483 aa  102  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 
427 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  36.88 
 
 
815 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  34.35 
 
 
269 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  37.04 
 
 
633 aa  60.5  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  31.33 
 
 
514 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  33.33 
 
 
808 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.26 
 
 
693 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  29.93 
 
 
595 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.01 
 
 
606 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  30 
 
 
643 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.62 
 
 
638 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  42.37 
 
 
437 aa  43.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7127  hypothetical protein  30.82 
 
 
403 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>