56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1705 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  100 
 
 
303 aa  624  1e-178  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0651  surface antigen  61.8 
 
 
232 aa  225  8e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  68.18 
 
 
207 aa  195  8.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1708  surface antigen  54.76 
 
 
256 aa  179  5.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.63868  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1630  surface antigen  63.5 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000382803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0110  surface antigen  51.39 
 
 
152 aa  153  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1614  surface antigen  56.25 
 
 
144 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000315849  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  44.29 
 
 
512 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  49.68 
 
 
377 aa  132  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  44.83 
 
 
416 aa  119  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  45.59 
 
 
324 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1519  hypothetical protein  40.7 
 
 
176 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00366032  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.54 
 
 
619 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.54 
 
 
619 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0897  hypothetical protein  48.82 
 
 
483 aa  105  8e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.86 
 
 
655 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  41.18 
 
 
468 aa  84.7  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.91 
 
 
574 aa  84.7  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  38.58 
 
 
381 aa  82  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  46.67 
 
 
390 aa  82  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  45.24 
 
 
449 aa  77  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  42.31 
 
 
482 aa  72.4  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  37.61 
 
 
933 aa  70.5  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  37.21 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  34.72 
 
 
815 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  38.46 
 
 
324 aa  62.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  36.9 
 
 
266 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  29.19 
 
 
808 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  39.29 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  39.29 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  30.16 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  30.16 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  38.1 
 
 
266 aa  57  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  32.09 
 
 
427 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  33.57 
 
 
633 aa  56.2  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  31.31 
 
 
279 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  31.31 
 
 
279 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  31.34 
 
 
595 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  28.27 
 
 
334 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  28.27 
 
 
334 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  32.11 
 
 
143 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  32.11 
 
 
143 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  33.33 
 
 
143 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.49 
 
 
693 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0047  CHAP domain containing protein  32.14 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.117415  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  31.82 
 
 
157 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  27.38 
 
 
514 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  30.56 
 
 
156 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  40.51 
 
 
269 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.9 
 
 
606 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  34.88 
 
 
582 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  39.66 
 
 
357 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  41.25 
 
 
397 aa  44.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  29.32 
 
 
643 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  36.21 
 
 
358 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  44 
 
 
360 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>