23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1519 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1519  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  365  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00366032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0897  hypothetical protein  44.87 
 
 
483 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  47.65 
 
 
377 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  49.32 
 
 
324 aa  128  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  47.1 
 
 
416 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1708  surface antigen  40.45 
 
 
256 aa  111  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.63868  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  40.7 
 
 
303 aa  111  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  41.96 
 
 
207 aa  106  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0651  surface antigen  35.84 
 
 
232 aa  106  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1630  surface antigen  38.64 
 
 
290 aa  100  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000382803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0110  surface antigen  38.82 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1614  surface antigen  47.83 
 
 
144 aa  82  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000315849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  34.01 
 
 
815 aa  70.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.79 
 
 
606 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  32.21 
 
 
269 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  28.87 
 
 
514 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.46 
 
 
693 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  28.4 
 
 
427 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  37.63 
 
 
595 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  29.93 
 
 
808 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  32.17 
 
 
633 aa  48.1  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  29.77 
 
 
643 aa  48.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.11 
 
 
638 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>