72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0597 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  100 
 
 
815 aa  1609    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  42 
 
 
514 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  24.53 
 
 
1202 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  52.11 
 
 
606 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  57.04 
 
 
595 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  24.16 
 
 
728 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  56.55 
 
 
808 aa  154  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  52.45 
 
 
269 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  32.2 
 
 
1042 aa  152  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  29.84 
 
 
769 aa  135  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  31.43 
 
 
403 aa  131  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  26.57 
 
 
938 aa  124  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  30.07 
 
 
374 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  22.38 
 
 
1001 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  30.74 
 
 
448 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  26.86 
 
 
675 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  25.41 
 
 
960 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  28.19 
 
 
996 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  25.94 
 
 
1361 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  23.05 
 
 
560 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  25.17 
 
 
669 aa  110  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.84 
 
 
693 aa  107  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  41.55 
 
 
643 aa  107  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  26.28 
 
 
1279 aa  100  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  25.27 
 
 
658 aa  99.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  22.19 
 
 
379 aa  99.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  22.57 
 
 
713 aa  98.6  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  24.74 
 
 
581 aa  95.5  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  43.65 
 
 
377 aa  92  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.33 
 
 
638 aa  85.1  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  36.31 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  22 
 
 
971 aa  79  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3727  hypothetical protein  25.75 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  36.59 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3324  hypothetical protein  22.87 
 
 
324 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0125921  normal  0.0119157 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0897  hypothetical protein  35.62 
 
 
483 aa  76.6  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  30.77 
 
 
171 aa  75.1  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  26.75 
 
 
685 aa  73.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1519  hypothetical protein  34.01 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00366032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  35.38 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0651  surface antigen  36.23 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3268  hypothetical protein  26.09 
 
 
329 aa  67.4  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0855187 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  34.72 
 
 
303 aa  65.5  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7127  hypothetical protein  38.02 
 
 
403 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  28.88 
 
 
771 aa  65.1  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  36.88 
 
 
207 aa  64.7  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  21.87 
 
 
819 aa  64.3  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  24.9 
 
 
679 aa  58.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0492  hypothetical protein  24.69 
 
 
195 aa  57.4  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.652654  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.21 
 
 
407 aa  56.2  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1708  surface antigen  32.17 
 
 
256 aa  54.7  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.63868  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1630  surface antigen  33.59 
 
 
290 aa  54.3  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000382803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0110  surface antigen  31.36 
 
 
152 aa  53.5  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1215  membrane attack complex component/perforin/complement C9  26.95 
 
 
466 aa  53.1  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.18029  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  25.12 
 
 
428 aa  52.4  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.43 
 
 
407 aa  52.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1614  surface antigen  37.97 
 
 
144 aa  51.2  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000315849  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  24.15 
 
 
445 aa  50.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  23.57 
 
 
2656 aa  49.7  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  32.28 
 
 
633 aa  50.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0858  WD40 domain protein beta Propeller  21.4 
 
 
439 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000315652  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  21.65 
 
 
422 aa  48.5  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  21.65 
 
 
422 aa  48.5  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  22.97 
 
 
560 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0495  hypothetical protein  28.21 
 
 
126 aa  48.1  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  22.52 
 
 
461 aa  46.6  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2360  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  22.5 
 
 
446 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.28939 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  24.35 
 
 
444 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.41 
 
 
2325 aa  45.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  24.35 
 
 
444 aa  44.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  24.35 
 
 
444 aa  44.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  26.24 
 
 
441 aa  44.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>