30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0495 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0495  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  257  5.0000000000000005e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0492  hypothetical protein  42.59 
 
 		 195 aa  92.8  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.652654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  40 
 
 		 1202 aa  88.2  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  38.66 
 
 		 448 aa  84.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  38.18 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  33.04 
 
 		 560 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  38.79 
 
 		 769 aa  75.1  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  35.04 
 
 		 938 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1001 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  28.35 
 
 		 728 aa  68.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  35.4 
 
 		 1042 aa  65.5  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  31.62 
 
 		 675 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  35.85 
 
 		 403 aa  64.3  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  32.17 
 
 		 713 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  30.63 
 
 		 669 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  44.59 
 
 		 1279 aa  60.5  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  44.59 
 
 		 1361 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  26.96 
 
 		 971 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  37.97 
 
 		 996 aa  55.1  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  30.83 
 
 		 379 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  26.56 
 
 		 960 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  31.25 
 
 		 581 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  34.15 
 
 		 685 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  28.21 
 
 		 815 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  27.03 
 
 		 658 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  38.16 
 
 		 517 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  40.68 
 
 		 679 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  26.85 
 
 		 374 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  24.35 
 
 		 819 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1181  hypothetical protein  37.21 
 
 		 442 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.726983  normal  0.0574597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>