24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1183 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  100 
 
 
633 aa  1263    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1215  membrane attack complex component/perforin/complement C9  37.25 
 
 
466 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.18029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7127  hypothetical protein  36.08 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.06 
 
 
638 aa  72  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  40 
 
 
324 aa  66.6  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  37.06 
 
 
377 aa  63.2  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  34.25 
 
 
416 aa  62.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  37.04 
 
 
207 aa  60.1  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.37 
 
 
693 aa  56.2  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  31.11 
 
 
514 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  33.57 
 
 
303 aa  55.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  32.59 
 
 
643 aa  54.7  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1630  surface antigen  32.85 
 
 
290 aa  50.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000382803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0110  surface antigen  34 
 
 
152 aa  49.7  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  32.28 
 
 
815 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1519  hypothetical protein  32.17 
 
 
176 aa  48.1  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00366032  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0432  hypothetical protein  37.78 
 
 
1002 aa  47.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.259517  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1614  surface antigen  34.86 
 
 
144 aa  47  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000315849  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.59 
 
 
714 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2012  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.13 
 
 
514 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0651  surface antigen  34.07 
 
 
232 aa  46.2  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.19 
 
 
606 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  33.33 
 
 
269 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1708  surface antigen  32.82 
 
 
256 aa  44.3  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.63868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>