23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1630 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1630  surface antigen  100 
 
 
290 aa  589  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000382803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1708  surface antigen  63.41 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.63868  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0651  surface antigen  64.29 
 
 
232 aa  194  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  68.94 
 
 
207 aa  188  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1614  surface antigen  66.94 
 
 
144 aa  176  3e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000315849  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  63.5 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0110  surface antigen  59.29 
 
 
152 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  48.18 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  45.75 
 
 
377 aa  115  6.9999999999999995e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0897  hypothetical protein  41.61 
 
 
483 aa  106  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  40.97 
 
 
416 aa  106  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1519  hypothetical protein  38.64 
 
 
176 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00366032  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  34.68 
 
 
427 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.06 
 
 
606 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  33.59 
 
 
595 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  34.06 
 
 
269 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  33.59 
 
 
815 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  31.91 
 
 
514 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.39 
 
 
693 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  30.66 
 
 
643 aa  52.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  32.85 
 
 
633 aa  50.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  33.33 
 
 
808 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.05 
 
 
638 aa  42.7  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>