34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5718 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
693 aa  1440    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  55.24 
 
 
643 aa  634  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.08 
 
 
638 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4239  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.23 
 
 
534 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3699  endoproteinase Arg-C  39.34 
 
 
483 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35914  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0494  endoproteinase Arg-C  42.32 
 
 
488 aa  296  8e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.072982  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02206  endoproteinase Arg-C  31.78 
 
 
465 aa  196  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02094  endoproteinase Arg-C  30.28 
 
 
434 aa  182  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.246327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09900  Pvds-regulated endoprotease, lysyl class  31.19 
 
 
462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00818916  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0919  Pvds-regulated endoprotease, lysyl class  29.76 
 
 
462 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1951  hypothetical protein  28.11 
 
 
667 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.04 
 
 
606 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  41.67 
 
 
595 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  29.48 
 
 
868 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  41.84 
 
 
815 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  40.56 
 
 
269 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  39.74 
 
 
514 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3637  hypothetical protein  29.64 
 
 
472 aa  89.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  34.69 
 
 
808 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  33.09 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  29.6 
 
 
823 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0897  hypothetical protein  31.94 
 
 
483 aa  79.3  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7127  hypothetical protein  31.37 
 
 
403 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  29.39 
 
 
427 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0553  extracellular protease, putative  28.15 
 
 
940 aa  74.7  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  33.1 
 
 
324 aa  69.7  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0651  surface antigen  38.46 
 
 
232 aa  64.7  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  30.34 
 
 
416 aa  62.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0110  surface antigen  30.95 
 
 
152 aa  61.2  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  28.26 
 
 
207 aa  55.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  29.37 
 
 
633 aa  55.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  26.49 
 
 
303 aa  53.5  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1630  surface antigen  27.39 
 
 
290 aa  53.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000382803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1519  hypothetical protein  27.46 
 
 
176 aa  52.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00366032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>