16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3637 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3637  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  969    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.19 
 
 		 638 aa  95.9  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.81 
 
 		 693 aa  90.1  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02206  endoproteinase Arg-C  30.65 
 
 		 465 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  33.69 
 
 		 868 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4239  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.73 
 
 		 534 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  29.02 
 
 		 643 aa  77  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09900  Pvds-regulated endoprotease, lysyl class  28.52 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00818916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0919  Pvds-regulated endoprotease, lysyl class  28.12 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02094  endoproteinase Arg-C  25.49 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.246327  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0494  endoproteinase Arg-C  30.52 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.072982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3699  endoproteinase Arg-C  30.99 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35914  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  29.79 
 
 		 823 aa  57.4  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1951  hypothetical protein  28.78 
 
 		 667 aa  50.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0023  PKD repeat-containing protein  29.09 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0553  extracellular protease, putative  27.69 
 
 		 940 aa  43.5  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>