15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4239 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4239  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
534 aa  1079    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  59.17 
 
 
643 aa  497  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.96 
 
 
638 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.23 
 
 
693 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3699  endoproteinase Arg-C  41.06 
 
 
483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35914  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0494  endoproteinase Arg-C  42.89 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.072982  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02206  endoproteinase Arg-C  33.41 
 
 
465 aa  200  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02094  endoproteinase Arg-C  31.63 
 
 
434 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.246327  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1951  hypothetical protein  30.47 
 
 
667 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0919  Pvds-regulated endoprotease, lysyl class  30.98 
 
 
462 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09900  Pvds-regulated endoprotease, lysyl class  28.69 
 
 
462 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00818916  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  29.72 
 
 
868 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  28.12 
 
 
823 aa  96.3  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3637  hypothetical protein  29.73 
 
 
472 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_002950  PG0553  extracellular protease, putative  30.96 
 
 
940 aa  80.5  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>