19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1951 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1951  hypothetical protein  100 
 
 		 667 aa  1371    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4239  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.47 
 
 		 534 aa  155  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02206  endoproteinase Arg-C  28.86 
 
 		 465 aa  153  8e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  31.01 
 
 		 643 aa  152  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.87 
 
 		 693 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02094  endoproteinase Arg-C  29.43 
 
 		 434 aa  145  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.246327  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3699  endoproteinase Arg-C  28.67 
 
 		 483 aa  143  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35914  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0494  endoproteinase Arg-C  27.7 
 
 		 488 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.072982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.94 
 
 		 638 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09900  Pvds-regulated endoprotease, lysyl class  29.87 
 
 		 462 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00818916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0919  Pvds-regulated endoprotease, lysyl class  30.3 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  26.34 
 
 		 868 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0735  hypothetical protein  40.54 
 
 		 763 aa  67.4  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000070765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3637  hypothetical protein  29.26 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  30.56 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0553  extracellular protease, putative  33.51 
 
 		 940 aa  53.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  23.55 
 
 		 823 aa  52.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.84 
 
 		 1143 aa  44.3  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  28.89 
 
 		 1313 aa  43.9  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>