73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2224 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 460 aa  940    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  50 
 
 		 833 aa  65.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  31.82 
 
 		 1376 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  39.02 
 
 		 868 aa  63.2  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  40.32 
 
 		 868 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  46.23 
 
 		 848 aa  60.8  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  47.37 
 
 		 863 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  32.95 
 
 		 1011 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  43.3 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  38.71 
 
 		 868 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1422  PKD domain containing protein  40 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  43.3 
 
 		 635 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1951  hypothetical protein  30.56 
 
 		 667 aa  57.4  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  45.83 
 
 		 848 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0152  PKD  30.72 
 
 		 506 aa  55.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000535415  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  45.1 
 
 		 855 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  40.24 
 
 		 450 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  38.46 
 
 		 1418 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  43.37 
 
 		 868 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  35.21 
 
 		 746 aa  53.9  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  43.16 
 
 		 994 aa  53.9  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  44.21 
 
 		 1771 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.3 
 
 		 913 aa  53.5  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1011 aa  53.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  42 
 
 		 972 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  43.9 
 
 		 665 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  40.23 
 
 		 868 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  40.23 
 
 		 868 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  40.23 
 
 		 867 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.83 
 
 		 1212 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  43.9 
 
 		 665 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  39.36 
 
 		 1393 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4525  Parallel beta-helix repeat protein  36 
 
 		 488 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000043731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  40 
 
 		 950 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  41.9 
 
 		 816 aa  51.2  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.47 
 
 		 1217 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  37.89 
 
 		 1311 aa  50.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  43.68 
 
 		 869 aa  50.4  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  34.97 
 
 		 1022 aa  50.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  34.17 
 
 		 994 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  39.18 
 
 		 611 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  31.91 
 
 		 706 aa  49.3  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  31.53 
 
 		 841 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  38.94 
 
 		 712 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  35.38 
 
 		 1265 aa  48.5  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  30 
 
 		 1309 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0728  hypothetical protein  24.51 
 
 		 667 aa  47.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0879674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  42.03 
 
 		 1750 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.25 
 
 		 351 aa  47.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.46 
 
 		 773 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  29.85 
 
 		 645 aa  47  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  35.43 
 
 		 634 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  35.58 
 
 		 1393 aa  46.6  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0423  hypothetical protein  34.86 
 
 		 809 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  33.64 
 
 		 1142 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  33.71 
 
 		 1739 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1678  hypothetical protein  39.53 
 
 		 940 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507171  hitchhiker  0.000632186 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  36.17 
 
 		 3278 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  35.25 
 
 		 1258 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  43.08 
 
 		 1220 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  34.62 
 
 		 734 aa  44.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  32.71 
 
 		 4978 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  34.96 
 
 		 1029 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2857  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1208 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  32.41 
 
 		 1057 aa  44.3  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  38.3 
 
 		 587 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  38.3 
 
 		 587 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  38.3 
 
 		 553 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  30.77 
 
 		 969 aa  43.5  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  38.3 
 
 		 587 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  38.3 
 
 		 587 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  39.32 
 
 		 826 aa  43.1  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  42.11 
 
 		 835 aa  43.1  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>