24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1678 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1678  hypothetical protein  100 
 
 		 940 aa  1879    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507171  hitchhiker  0.000632186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  60.87 
 
 		 651 aa  195  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3634  hypothetical protein  48.09 
 
 		 482 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  hitchhiker  0.000640384 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  48.12 
 
 		 1147 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4489  hypothetical protein  48.12 
 
 		 319 aa  138  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.488935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1406  hypothetical protein  46.79 
 
 		 396 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0988  hypothetical protein  43.12 
 
 		 990 aa  126  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1506  hypothetical protein  48.33 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00662762  hitchhiker  0.0000622749 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  46.99 
 
 		 969 aa  62.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  43.02 
 
 		 1557 aa  62  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  42.68 
 
 		 1608 aa  52.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  31.3 
 
 		 1771 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  38.06 
 
 		 665 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2857  hypothetical protein  40.48 
 
 		 1208 aa  49.7  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.04 
 
 		 2668 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  40.86 
 
 		 460 aa  48.9  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  34 
 
 		 2105 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  31.58 
 
 		 1011 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  36.78 
 
 		 884 aa  45.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  38.03 
 
 		 1300 aa  45.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  32.2 
 
 		 868 aa  45.4  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  40.43 
 
 		 1376 aa  45.4  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  28.92 
 
 		 867 aa  45.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  36 
 
 		 1004 aa  44.7  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>