79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2313 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 450 aa  891    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  31.76 
 
 		 479 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  28.43 
 
 		 816 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  32.29 
 
 		 277 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  29.41 
 
 		 581 aa  123  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  33.21 
 
 		 401 aa  120  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  34.44 
 
 		 618 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  28.9 
 
 		 586 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  33.59 
 
 		 1389 aa  113  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  34.15 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.11 
 
 		 1679 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  36.28 
 
 		 318 aa  99.8  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  34.76 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  28.51 
 
 		 386 aa  90.1  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  28.02 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  29.03 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  28.5 
 
 		 631 aa  81.3  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  36.31 
 
 		 1059 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  43.48 
 
 		 863 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  32.75 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1110  putative lipoprotein  29.13 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.78 
 
 		 1293 aa  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  36.08 
 
 		 848 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1488  hypothetical protein  27.72 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0421806  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  35.05 
 
 		 855 aa  61.6  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  36.54 
 
 		 867 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  40 
 
 		 3278 aa  61.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  40.51 
 
 		 833 aa  60.1  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  36.54 
 
 		 868 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  36.54 
 
 		 868 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  36.54 
 
 		 868 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  37.14 
 
 		 868 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  33.65 
 
 		 1258 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  35.79 
 
 		 1300 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  35.79 
 
 		 1300 aa  57.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  37.65 
 
 		 1298 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  37.65 
 
 		 1298 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  37.65 
 
 		 1298 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  37.65 
 
 		 1298 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  28.29 
 
 		 273 aa  57  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  36.75 
 
 		 868 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.42 
 
 		 913 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  35.29 
 
 		 868 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  34.34 
 
 		 950 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  40.24 
 
 		 460 aa  55.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  41.38 
 
 		 1311 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  38.54 
 
 		 1393 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  35.05 
 
 		 1265 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  30.39 
 
 		 994 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  31.58 
 
 		 848 aa  54.7  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  35.8 
 
 		 869 aa  54.7  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  28.99 
 
 		 419 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.11 
 
 		 911 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  30.11 
 
 		 972 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  35.63 
 
 		 1750 aa  50.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  31.25 
 
 		 861 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  27.07 
 
 		 755 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  27.07 
 
 		 755 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  27.33 
 
 		 731 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  27.33 
 
 		 755 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  35.48 
 
 		 635 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1744 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  33.73 
 
 		 746 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  37.97 
 
 		 1393 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1011 aa  46.6  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  35.48 
 
 		 635 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  31.9 
 
 		 1015 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2764  PKD domain containing protein  30.58 
 
 		 1084 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  26.79 
 
 		 1780 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  35.71 
 
 		 1107 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  29.97 
 
 		 1041 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  35.63 
 
 		 611 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  33.15 
 
 		 863 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0686  hypothetical protein  34.38 
 
 		 732 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.621901  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  46.51 
 
 		 1004 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  27.84 
 
 		 661 aa  43.9  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  47.73 
 
 		 3197 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  17.74 
 
 		 310 aa  43.5  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  26.74 
 
 		 765 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>