63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5348 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  100 
 
 
950 aa  1892    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  35.31 
 
 
1311 aa  205  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  34.82 
 
 
1393 aa  195  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  34.9 
 
 
1393 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1217  metalloprotease, putative  33.41 
 
 
839 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000727805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2538  coagulation factor 5/8 type-like protein  29.05 
 
 
1043 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01650  Extracellular elastinolytic metalloproteinase precursor, putative  27.68 
 
 
831 aa  106  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.462944  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2937  protease-associated PA  43.4 
 
 
730 aa  99  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3023  protease-associated PA domain protein  41.77 
 
 
730 aa  97.8  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0449431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3130  peptidase M36 fungalysin  42.11 
 
 
730 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146648  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1810  peptidase M36, fungalysin  26.7 
 
 
1146 aa  89  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0492  peptidase M36 fungalysin  28.77 
 
 
1147 aa  81.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.921805 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  43.14 
 
 
972 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  30.18 
 
 
887 aa  75.5  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04145  metalloprotease, putative  36.23 
 
 
935 aa  73.2  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.18498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  36.54 
 
 
1750 aa  69.7  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  32.69 
 
 
833 aa  67.8  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3266  peptidase M36 fungalysin  26.42 
 
 
1168 aa  67  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0508645  normal  0.0224871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  39.25 
 
 
1011 aa  67  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  27.35 
 
 
927 aa  65.5  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  36.79 
 
 
848 aa  63.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  30.67 
 
 
1265 aa  61.2  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  37.39 
 
 
746 aa  60.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.9 
 
 
1217 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  40.21 
 
 
820 aa  57.4  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  33.94 
 
 
994 aa  57.4  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  38.82 
 
 
863 aa  57  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.97 
 
 
911 aa  57  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  42.86 
 
 
994 aa  56.6  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  35.29 
 
 
868 aa  55.5  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  34.34 
 
 
450 aa  54.7  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  34.15 
 
 
816 aa  54.7  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  36.36 
 
 
855 aa  54.3  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  31.15 
 
 
656 aa  53.5  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  28.46 
 
 
3278 aa  53.5  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.74 
 
 
1212 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00841  PKD domain protein  34.02 
 
 
1098 aa  52.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  29.46 
 
 
868 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  29.46 
 
 
868 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  29.46 
 
 
868 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  29.91 
 
 
867 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  36.73 
 
 
826 aa  52  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0423  hypothetical protein  34.94 
 
 
809 aa  51.2  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  40 
 
 
460 aa  51.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  36.08 
 
 
848 aa  50.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  32.56 
 
 
868 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  36.63 
 
 
1004 aa  49.7  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  35.56 
 
 
600 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  30.28 
 
 
1258 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  30.84 
 
 
611 aa  49.7  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  31.4 
 
 
868 aa  48.5  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.52 
 
 
1293 aa  48.1  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  33.33 
 
 
635 aa  48.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  38.1 
 
 
665 aa  48.1  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  31.31 
 
 
985 aa  47.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  38.1 
 
 
665 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  34.26 
 
 
1376 aa  46.6  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  44.83 
 
 
1608 aa  46.2  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0783  hypothetical protein  37.21 
 
 
528 aa  46.2  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.07808  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  38.46 
 
 
587 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  41.67 
 
 
1011 aa  45.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  28.9 
 
 
1298 aa  44.7  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.63 
 
 
913 aa  44.3  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>