97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2953 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  100 
 
 		 1004 aa  2043    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4751  fibro-slime family protein  49.77 
 
 		 256 aa  214  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0364  fibro-slime family protein  40.93 
 
 		 570 aa  156  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.227511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1821  hypothetical protein  31.49 
 
 		 892 aa  124  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  39.74 
 
 		 926 aa  122  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3548  type II secretion system protein C  31.32 
 
 		 980 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  44.88 
 
 		 489 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  34.39 
 
 		 630 aa  110  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1188  fibro-slime family protein  40 
 
 		 271 aa  109  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  41.61 
 
 		 484 aa  105  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  36.1 
 
 		 423 aa  101  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0551  hypothetical protein  32.8 
 
 		 944 aa  94  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  48.72 
 
 		 897 aa  92.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  39.51 
 
 		 3471 aa  85.5  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  39.51 
 
 		 3472 aa  85.1  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  39.29 
 
 		 3521 aa  84.7  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  45.29 
 
 		 2313 aa  82.8  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1237  hypothetical protein  28.34 
 
 		 885 aa  82  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  42.86 
 
 		 635 aa  82  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  47.06 
 
 		 635 aa  81.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  45.57 
 
 		 444 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  50 
 
 		 1011 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  41.27 
 
 		 634 aa  78.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0549  hypothetical protein  45.73 
 
 		 501 aa  77.4  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  41.44 
 
 		 706 aa  75.1  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  43.56 
 
 		 1022 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  58.54 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  28.22 
 
 		 602 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  41.18 
 
 		 991 aa  70.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.07 
 
 		 830 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  44.77 
 
 		 3409 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  49.45 
 
 		 1376 aa  68.2  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  35.79 
 
 		 332 aa  66.6  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  34.44 
 
 		 1261 aa  66.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  43.14 
 
 		 868 aa  64.7  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  42.16 
 
 		 868 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  39.13 
 
 		 868 aa  63.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1217  hypothetical protein  23.96 
 
 		 997 aa  62  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  40.68 
 
 		 522 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  41.04 
 
 		 344 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  28.66 
 
 		 884 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  42.31 
 
 		 869 aa  59.3  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  33.96 
 
 		 712 aa  59.3  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4525  Parallel beta-helix repeat protein  38.54 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000043731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1197 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  24.62 
 
 		 928 aa  58.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  43.62 
 
 		 665 aa  58.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  46.32 
 
 		 1418 aa  58.2  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  31.58 
 
 		 1888 aa  57.8  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  44.9 
 
 		 969 aa  57.4  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  35.79 
 
 		 1771 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  56.25 
 
 		 833 aa  55.8  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  43.3 
 
 		 867 aa  55.5  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 868 aa  55.5  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  42.86 
 
 		 868 aa  55.5  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05650  fibro-slime domain-containing protein  37.5 
 
 		 1104 aa  55.5  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 868 aa  55.5  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  35.67 
 
 		 625 aa  55.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1090  hypothetical protein  34.02 
 
 		 231 aa  55.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  35.56 
 
 		 835 aa  55.1  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  38.82 
 
 		 1601 aa  54.3  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4281  cell surface protein  31.17 
 
 		 953 aa  53.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.533345  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  34.58 
 
 		 746 aa  53.5  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  32.54 
 
 		 5185 aa  53.5  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1735  hypothetical protein  37.14 
 
 		 246 aa  52.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557207  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  52.54 
 
 		 539 aa  52  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.3 
 
 		 351 aa  51.6  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2252  TPR repeat-containing protein  39.07 
 
 		 1022 aa  51.6  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0647167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  41.05 
 
 		 665 aa  51.2  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  50.88 
 
 		 613 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  40.94 
 
 		 857 aa  51.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  30.25 
 
 		 551 aa  50.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  52.27 
 
 		 772 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  42.17 
 
 		 863 aa  50.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00841  PKD domain protein  38.37 
 
 		 1098 aa  49.3  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  34.34 
 
 		 985 aa  49.3  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  37.37 
 
 		 848 aa  49.7  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22510  hypothetical protein  40.91 
 
 		 608 aa  49.3  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.818778 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  33.33 
 
 		 453 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  48 
 
 		 1750 aa  49.3  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  34.74 
 
 		 1011 aa  48.9  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  31.9 
 
 		 555 aa  48.5  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0449  hypothetical protein  49.12 
 
 		 611 aa  48.5  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00263959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0459  hypothetical protein  49.12 
 
 		 611 aa  48.5  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0872017  normal  0.526818 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  32.41 
 
 		 671 aa  48.1  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  34.44 
 
 		 407 aa  48.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  38.81 
 
 		 687 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3858  rhs element Vgr protein  51.19 
 
 		 258 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  36.63 
 
 		 950 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  54.39 
 
 		 525 aa  47  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  35.35 
 
 		 972 aa  47  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  45.65 
 
 		 600 aa  47  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6555  lipopolysaccharide biosynthesis protein  51.61 
 
 		 413 aa  46.2  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  31.16 
 
 		 3242 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4832  FtsK/SpoIIIE family protein  28.9 
 
 		 1266 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0790517  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1646  hypothetical protein  41.54 
 
 		 717 aa  45.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.061153 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03550  hypothetical protein  47.06 
 
 		 1602 aa  44.7  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>