15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1735 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1735  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4751  fibro-slime family protein  32.03 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  27.81 
 
 		 1004 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1873  hypothetical protein  64.86 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00684025  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2195  hypothetical protein  40.58 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1188  fibro-slime family protein  30.4 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0364  fibro-slime family protein  24.02 
 
 		 570 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.227511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1990  hypothetical protein  52.63 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000122481  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2327  hypothetical protein  42.62 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2584  hypothetical protein  31.48 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00315889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0158  hypothetical protein  59.38 
 
 		 279 aa  42.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000130307  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0383  PA14 domain protein  31.48 
 
 		 578 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0513  hypothetical protein  62.5 
 
 		 266 aa  42  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255083  normal  0.277603 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2396  hypothetical protein  37.31 
 
 		 166 aa  42  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000890188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0373  hypothetical protein  59.38 
 
 		 279 aa  42  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00337084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>