160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4370 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 344 aa  632  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  57.93 
 
 		 283 aa  328  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  45.95 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  46.18 
 
 		 288 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  44.21 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  47 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  56.29 
 
 		 2851 aa  145  9e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  58.33 
 
 		 382 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  59.06 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  47.22 
 
 		 222 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  41.07 
 
 		 300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  59.18 
 
 		 319 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  42.79 
 
 		 582 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  53.37 
 
 		 2914 aa  109  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  35.48 
 
 		 473 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  41.71 
 
 		 936 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  40.22 
 
 		 1219 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  47.77 
 
 		 606 aa  106  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  43.29 
 
 		 815 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  42.77 
 
 		 1055 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  43.33 
 
 		 524 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  46.56 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  41.53 
 
 		 767 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  37.3 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  55.92 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  41.29 
 
 		 459 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  39.04 
 
 		 645 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  36.08 
 
 		 493 aa  97.1  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  47.1 
 
 		 813 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  38.01 
 
 		 469 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  42.86 
 
 		 462 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  37.79 
 
 		 647 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  45.73 
 
 		 1147 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  45.09 
 
 		 748 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  45.51 
 
 		 468 aa  94  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  47.5 
 
 		 835 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  49.01 
 
 		 643 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  44.03 
 
 		 587 aa  93.2  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  34.72 
 
 		 492 aa  92  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  49.01 
 
 		 512 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  48.1 
 
 		 481 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  48.1 
 
 		 478 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  49.64 
 
 		 689 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  41.15 
 
 		 842 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  40.76 
 
 		 252 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  48.03 
 
 		 585 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  46.15 
 
 		 1168 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  47.68 
 
 		 706 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  41.77 
 
 		 466 aa  87.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  45.73 
 
 		 712 aa  87  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  41.01 
 
 		 400 aa  86.7  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  47.2 
 
 		 835 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  43.14 
 
 		 835 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  42.52 
 
 		 380 aa  86.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  49.25 
 
 		 867 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  45.45 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  45.45 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  40 
 
 		 639 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  39.26 
 
 		 523 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  40.48 
 
 		 1297 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  42.33 
 
 		 1101 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  53.44 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  52.89 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  52.89 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  41.22 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  42.54 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  42.07 
 
 		 1451 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  41.6 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  39.52 
 
 		 1170 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  36 
 
 		 648 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  43.84 
 
 		 838 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  42.47 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5433  triple helix repeat-containing collagen  42.37 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  47.13 
 
 		 951 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  41.36 
 
 		 839 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  33.06 
 
 		 688 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  45.33 
 
 		 934 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  47.77 
 
 		 1321 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  42.45 
 
 		 582 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  40.12 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  46.45 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  44.75 
 
 		 1873 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  42.11 
 
 		 1426 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  41.8 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  37.23 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  42.26 
 
 		 1580 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  31.47 
 
 		 835 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  51.72 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  45.65 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  50 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  50.96 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  48.25 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  48.25 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  33.2 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1592  Collagen triple helix repeat protein  37.38 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1937  triple helix repeat-containing collagen  49.62 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  34.62 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0538  triple helix repeat-containing collagen  35.87 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  46.85 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  40.16 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>