164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1202 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 400 aa  780    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  73.86 
 
 		 403 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  51.32 
 
 		 2914 aa  164  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  67.61 
 
 		 689 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  51.82 
 
 		 842 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  59.36 
 
 		 585 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  59.32 
 
 		 643 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  45 
 
 		 813 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  51.05 
 
 		 2851 aa  146  8.000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  55.73 
 
 		 712 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  57.29 
 
 		 512 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  59.07 
 
 		 835 aa  143  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  56.98 
 
 		 706 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  55.03 
 
 		 1147 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  56.83 
 
 		 748 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  54.55 
 
 		 1168 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  42.2 
 
 		 462 aa  135  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  55.15 
 
 		 582 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  39.07 
 
 		 835 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  51.55 
 
 		 936 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  41.89 
 
 		 835 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  49.28 
 
 		 1101 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  41.84 
 
 		 322 aa  133  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  44.17 
 
 		 1297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  37.58 
 
 		 459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  45.27 
 
 		 481 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  45.27 
 
 		 478 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  49.49 
 
 		 442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  52.58 
 
 		 1451 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  42.67 
 
 		 492 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  36.78 
 
 		 319 aa  129  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  36.54 
 
 		 867 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  46.11 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  52.46 
 
 		 838 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  46.94 
 
 		 587 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  58.86 
 
 		 951 aa  126  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  37.13 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  46.43 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  47.64 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  37.43 
 
 		 934 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  48.52 
 
 		 606 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  60.23 
 
 		 1170 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  46.67 
 
 		 815 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  47.14 
 
 		 1580 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  52.17 
 
 		 835 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  36.92 
 
 		 347 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  36.92 
 
 		 347 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  47.74 
 
 		 542 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  38.05 
 
 		 1321 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  38.65 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  43.69 
 
 		 493 aa  116  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  38.87 
 
 		 582 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  44.5 
 
 		 1219 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  37.61 
 
 		 524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  37.5 
 
 		 645 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  43.46 
 
 		 1055 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  39.91 
 
 		 1873 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  41.08 
 
 		 474 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  43.43 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  37.76 
 
 		 639 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  58.12 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  45.1 
 
 		 437 aa  106  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  44.97 
 
 		 523 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  41.15 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  48.63 
 
 		 348 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  40.41 
 
 		 274 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  58.25 
 
 		 451 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  60 
 
 		 436 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  49.73 
 
 		 298 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  58.25 
 
 		 437 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  58.25 
 
 		 437 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  56.12 
 
 		 438 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  58.25 
 
 		 434 aa  94  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  48.2 
 
 		 252 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  34.83 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  51.43 
 
 		 344 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  34.11 
 
 		 647 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  34.13 
 
 		 469 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  35.39 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3121  mucin 17-like protein  39.88 
 
 		 1788 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  49.65 
 
 		 307 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  37.89 
 
 		 258 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.74 
 
 		 473 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  49.35 
 
 		 580 aa  87  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  53.92 
 
 		 1426 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  56.25 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  44 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  55.95 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  39.29 
 
 		 240 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  59.76 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  44.09 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  40.65 
 
 		 300 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  41.79 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  60.81 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  46.95 
 
 		 767 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  54.02 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  35.81 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  54.88 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1584 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  41.62 
 
 		 839 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>