144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2256 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 
326 aa  555  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  66.98 
 
 
300 aa  325  5e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  65.8 
 
 
348 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  75.11 
 
 
252 aa  273  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2199  collagen-like protein  65.33 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.76687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  71.19 
 
 
462 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  61.48 
 
 
285 aa  209  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  74.77 
 
 
459 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  70.42 
 
 
815 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  66.41 
 
 
1055 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  73.52 
 
 
1219 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  64.22 
 
 
1451 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  64.98 
 
 
936 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  61.9 
 
 
524 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  60.59 
 
 
1168 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  60.71 
 
 
1147 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  59.11 
 
 
813 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  60.81 
 
 
748 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  56.12 
 
 
639 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  70.23 
 
 
606 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  54.59 
 
 
842 aa  162  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2484  hypothetical protein  80.43 
 
 
258 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00229925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  61.04 
 
 
426 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  55.71 
 
 
712 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  48.56 
 
 
512 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  53.47 
 
 
706 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  53.71 
 
 
469 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  60.27 
 
 
1580 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  51.14 
 
 
835 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  52.72 
 
 
643 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  44.36 
 
 
1321 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  49.17 
 
 
585 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  34.76 
 
 
1408 aa  143  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  50.92 
 
 
835 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  50.99 
 
 
1297 aa  139  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  44.61 
 
 
934 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  52.27 
 
 
835 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  48.29 
 
 
838 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  43.8 
 
 
1170 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  41.98 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  41.26 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  43.91 
 
 
867 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  66.88 
 
 
380 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  42.07 
 
 
951 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  38.1 
 
 
442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  36.64 
 
 
298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  43.24 
 
 
542 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  44.55 
 
 
2914 aa  116  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  45 
 
 
835 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  42.79 
 
 
466 aa  112  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  42.31 
 
 
492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  64.71 
 
 
647 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  49.06 
 
 
481 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  51.85 
 
 
478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  50.31 
 
 
473 aa  110  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  43.16 
 
 
582 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  41.26 
 
 
468 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  73.21 
 
 
347 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  73.21 
 
 
347 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  37.02 
 
 
587 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  65.05 
 
 
299 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  77.95 
 
 
300 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  59.78 
 
 
474 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2450  hypothetical protein  60.71 
 
 
366 aa  99.4  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.636988  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  68.22 
 
 
274 aa  99.4  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  38.41 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  40.8 
 
 
403 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  32.26 
 
 
1873 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1694  triple helix repeat-containing collagen  55.6 
 
 
1148 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  39.64 
 
 
493 aa  92.4  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2281  hypothetical protein  65.33 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  68.42 
 
 
258 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  40.96 
 
 
444 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  31.85 
 
 
645 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  80 
 
 
445 aa  90.1  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  51.63 
 
 
523 aa  89.4  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  71.91 
 
 
390 aa  87  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  39.23 
 
 
582 aa  86.7  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  30.72 
 
 
767 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  37.63 
 
 
497 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  39.33 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  50.93 
 
 
717 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  41.62 
 
 
648 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2213  hypothetical protein  49.43 
 
 
1035 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  71.05 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  38.7 
 
 
1101 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  39.29 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  81.82 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4423  triple helix repeat-containing collagen  79.09 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000283888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  39.42 
 
 
307 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  39.74 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  35 
 
 
839 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  31.84 
 
 
2851 aa  73.9  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3260  triple helix repeat-containing collagen  66.99 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.524263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  65.12 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3507  collagen triple helix repeat protein  53.33 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  44.96 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  32.85 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  70 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1759  collagen triple helix repeat protein  52.38 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  normal  0.788316 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>