142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0682 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 542 aa  969    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  42.68 
 
 		 1055 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  42.86 
 
 		 1219 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  47.32 
 
 		 842 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  43.07 
 
 		 815 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  39.55 
 
 		 936 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  46.21 
 
 		 1168 aa  207  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  40.18 
 
 		 748 aa  200  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  37.87 
 
 		 813 aa  199  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  40.74 
 
 		 706 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  44.23 
 
 		 462 aa  196  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  42.82 
 
 		 1147 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  42.67 
 
 		 512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  43.34 
 
 		 712 aa  189  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  42.96 
 
 		 835 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  37.52 
 
 		 835 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  41.43 
 
 		 1451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  44.44 
 
 		 1297 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  43.83 
 
 		 1580 aa  181  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  48.87 
 
 		 2914 aa  180  4.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  45.12 
 
 		 459 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  44.58 
 
 		 1170 aa  180  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  44.87 
 
 		 835 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  42.08 
 
 		 643 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  38.65 
 
 		 838 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  46.35 
 
 		 1321 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  41.96 
 
 		 951 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  43.34 
 
 		 934 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  39.86 
 
 		 867 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  35.95 
 
 		 835 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  46.12 
 
 		 606 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  43.1 
 
 		 585 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  48.87 
 
 		 442 aa  139  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  47.79 
 
 		 319 aa  139  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  43.27 
 
 		 645 aa  136  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  43.61 
 
 		 1873 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  51.06 
 
 		 322 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  39.6 
 
 		 639 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  42.64 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 582 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  42.02 
 
 		 444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  47.5 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  45.49 
 
 		 492 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  51.98 
 
 		 403 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  45.66 
 
 		 298 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  51.5 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  44.68 
 
 		 382 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  46.38 
 
 		 587 aa  106  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  42.51 
 
 		 468 aa  106  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  49.03 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  40 
 
 		 466 aa  104  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  42.53 
 
 		 478 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  38.11 
 
 		 426 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  47.87 
 
 		 481 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  48.8 
 
 		 1101 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  37.81 
 
 		 469 aa  98.6  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  50.31 
 
 		 689 aa  98.6  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  48.61 
 
 		 252 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  40.8 
 
 		 582 aa  94  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  46.3 
 
 		 348 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  45.83 
 
 		 493 aa  91.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  44.94 
 
 		 647 aa  90.9  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  40.7 
 
 		 366 aa  90.5  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  43.12 
 
 		 523 aa  90.1  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  55.71 
 
 		 344 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  51.41 
 
 		 2851 aa  88.6  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3121  mucin 17-like protein  30.94 
 
 		 1788 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  45.24 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  44.52 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  40.5 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  39.29 
 
 		 717 aa  84  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  50.4 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  50.4 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  51.38 
 
 		 347 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  51.38 
 
 		 347 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  45 
 
 		 474 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  38.49 
 
 		 767 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  45.64 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  37.94 
 
 		 497 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  47.71 
 
 		 274 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  53.47 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  53.47 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  53.47 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  44.69 
 
 		 839 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  31.68 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  52.48 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  53.68 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  51.49 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  26.61 
 
 		 688 aa  70.5  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  49.06 
 
 		 436 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  34.94 
 
 		 648 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  36.43 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  44.65 
 
 		 580 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  43.96 
 
 		 390 aa  67  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  54.55 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  47.58 
 
 		 1426 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  49.06 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.18 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  47.83 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  55.07 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>